Geen
RPIA
ribose 5-phosphate isomerase A
- HGNC 10297↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000153574↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 22934↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2p11.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 88 691 673–88 750 929 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 59,3 kb
- Valk
- 311 aminohapet
- MANE Select transkript
- ENST00000283646.5NM_144563.3
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rpia.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe RPIA ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Kuidas RPIA on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,8 kb kogupikkusega 59,3 kb; neist 936 alust kodeerivad valku.
RPIA sekventeerimine
4Madal
Kui raske on RPIA lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa RPIA eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.5,4%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.30%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
5
positsioonid geenis RPIA, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.
Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu RPIA 59,3 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 1,8 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
- ACER3alkaline ceramidase 3Jagab 1 haigust
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 1 haigust
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Jagab 1 haigust
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Jagab 1 haigust
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Jagab 1 haigust
- ARSAarylsulfatase AJagab 1 haigust
- ASPAaspartoacylaseJagab 1 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 1 haigust
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Jagab 1 haigust
Geeniga RPIA seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RPIA võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating ribitol concentration
- Decreased CSF erythritol concentration
- Decreased level of erythritol in urine
- Elevated circulating D-threitol concentration
- Increased CSF D-threitol concentration
- Increased CSF ribitol concentration
- Increased CSF ribose concentration
- Increased CSF xylitol concentration
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-17: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RPIA geen: ribose 5-phosphate isomerase A. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rpia
Dante Labs. RPIA geen: ribose 5-phosphate isomerase A [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rpia
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast