Geen
RAB3GAP1
RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1
- HGNC 17063↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000115839↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 22930↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q21.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 135 052 292–135 170 710 (GRCh38)
- Eksonid
- 24 eksonit, ulatus 118,4 kb
- Valk
- 981 aminohapet
- Tuntud ka kui
- RAB3GAP, KIAA0066, RAB3GAP130, WARBM1
- MANE Select transkript
- ENST00000264158.13NM_012233.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RAB3GAP1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Mikroftalmia, anoftalmia ja kolobooma
- Sündroomne mikroftalmia
Mikroftalmia, mis esineb koos silmaväliste tunnustega ning mida põhjustavad muutused geenides nagu SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geneetiline diagnoos suunab kontrolli seotud tunnuste suhtes, näiteks hüpofüüsi hormoonitalitluse häired SOX2 või OTX2 korral, ning aitab hinnata kordumise riski.
Kuidas RAB3GAP1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,9 kb kogupikkusega 118,4 kb; neist 2946 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RAB3GAP1
42
kohad geenis RAB3GAP1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RAB3GAP1 118,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,9 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- BCORBCL6 corepressorJagab 1 haigust
- BMP4bone morphogenetic protein 4Jagab 1 haigust
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BJagab 1 haigust
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitJagab 1 haigust
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitJagab 1 haigust
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseJagab 1 haigust
- FAT1FAT atypical cadherin 1Jagab 1 haigust
- HCCSholocytochrome c synthaseJagab 1 haigust
- HMX1H6 family homeobox 1Jagab 1 haigust
- MAB21L2mab-21 like 2Jagab 1 haigust
- NDUFB11NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11Jagab 1 haigust
- OTX2orthodenticle homeobox 2Jagab 1 haigust
Geeniga RAB3GAP1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RAB3GAP1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Enlarged sylvian cistern
- Global developmental delay
- Intellectual disability, severe
- Lateral ventricle dilatation
- Perisylvian polymicrogyria
- Small cerebellum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
Näita veel 14 tunnust
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Intellectual disability
- Brain degeneration
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed CNS myelination
- Increased reflexes
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of the cerebellum
- Epilepsy
- Peripheral neuropathy
- Agenesis of corpus callosum
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Permanent flexion of the finger or toe
- Spastic diplegia
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint stiffness
- Low muscle tone
- Hunched back
- Prominent swayback
- Scoliosis
Näita veel 3 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RAB3GAP1 geen: RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rab3gap1
Dante Labs. RAB3GAP1 geen: RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rab3gap1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast