Geen
TMEM163
transmembrane protein 163
- HGNC 25380↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000152128↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 81615↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q21.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 134 455 759–134 719 000 (GRCh38)
- Eksonid
- 8 eksonit, ulatus 263,2 kb
- Valk
- 289 aminohapet
- Tuntud ka kui
- DKFZP566N034, SV31, SLC30A11
- MANE Select transkript
- ENST00000281924.6NM_030923.5
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tmem163.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe TMEM163 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Pelizaeus-Merzbacher'i tõbi ja hüpomüeliniseerivad leukodüstroofiad
- Hüpomüeliniseeriv leukodüstroofia 25 (TMEM163)Autosoomne dominantne
Hüpomüeliniseeriva leukodüstroofia haruldane pärilik vorm, mille puhul aju müeliin ei moodustu normaalselt, põhjustades arengu viivitust ja liikumishäireid.
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Pärilikud neurodegeneratiivsed häired
- KIF5A-ga seotud neurodegeneratiivne häireAutosoomne dominantne
Üks 372 sellega seotud geenist
Põhjustatud KIF5A ühe koopia muutustest. Geen kodeerib motoorset valku, millel on kargo-siduv saba. Erinevat tüüpi muutused viivad erinevate haiguste tekkeni: pärilik spastiline paraplegia tüüp 10, Charcot-Marie-Tooth haiguse aksonaalne vorm ja amüotroofne lateraalskleroos (ALS).
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Ravi on sümptomaatiline ja sõltub haiguse avaldumisest; see hõlmab füsioteraapiat, spastilisuse vastaseid ravimeid ja multidistsiplinaarset ALS-i ravi. Haige inimese iga laps pärib muutuse 1 :2 tõenäosusega. Geneetiline nõustamine aitab peredel seda mõista.
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Kuidas TMEM163 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 263,2 kb; neist 870 alust kodeerivad valku.
TMEM163 sekveneerimine
1
positsioon geenis TMEM163, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti tabavad.
Terve genoom katab kogu geeni TMEM163 263,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksonite 1,9 kb.
ClinVar pathogenic variants (1)
The TMEM163 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne 1
| Variant | Conditions | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|
| NM_030923.5(TMEM163):c.227T>C (p.Leu76Pro) (opens in a new tab) | leukodystrophy, hypomyelinating, 25 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 2 haigust
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 2 haigust
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 2 haigust
- ACER3alkaline ceramidase 3Jagab 2 haigust
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 2 haigust
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Jagab 2 haigust
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Jagab 2 haigust
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Jagab 2 haigust
- ARSAarylsulfatase AJagab 2 haigust
- ASPAaspartoacylaseJagab 2 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 2 haigust
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Jagab 2 haigust
Geeniga TMEM163 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TMEM163 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-18: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.18-8b139e39.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TMEM163 geen: transmembrane protein 163. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/tmem163
Dante Labs. TMEM163 geen: transmembrane protein 163 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/tmem163
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast