Geeni
RAB3GAP1
RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1
- HGNC 17063↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000115839↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 22930↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q21.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 135 052 292–135 170 710 (GRCh38)
- Eksonit
- 24 eksonia 118,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 981 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- RAB3GAP, KIAA0066, RAB3GAP130, WARBM1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000264158.13NM_012233.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RAB3GAP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Mikrophthalmia, anophthalmia ja koloboma
- Oireyhtymään liittyvä mikrophthalmia
Mikrophthalmia, johon liittyy silmän ulkopuolisia piirteitä. Sen aiheuttavat muutokset geeneissä, kuten SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettinen diagnoosi ohjaa niiden liitännäisoireiden tarkastuksia, kuten aivolisäkkeen hormonihäiriöiden seurantaa SOX2- tai OTX2-muutosten yhteydessä, ja auttaa arvioimaan uusiutumisriskiä.
RAB3GAP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,9 kb geenin 118,4 kb:stä; 2 946 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RAB3GAP1
42
RAB3GAP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 118,4 kb geenistä RAB3GAP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BCORBCL6 corepressorYhteinen sairaus: 1
- BMP4bone morphogenetic protein 4Yhteinen sairaus: 1
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BYhteinen sairaus: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseYhteinen sairaus: 1
- FAT1FAT atypical cadherin 1Yhteinen sairaus: 1
- HCCSholocytochrome c synthaseYhteinen sairaus: 1
- HMX1H6 family homeobox 1Yhteinen sairaus: 1
- MAB21L2mab-21 like 2Yhteinen sairaus: 1
- NDUFB11NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11Yhteinen sairaus: 1
- OTX2orthodenticle homeobox 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin RAB3GAP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RAB3GAP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to walk
- Enlarged sylvian cistern
- Global developmental delay
- Intellectual disability, severe
- Lateral ventricle dilatation
- Perisylvian polymicrogyria
- Small cerebellum
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
Näytä 14 piirrettä lisää
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Intellectual disability
- Brain degeneration
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed CNS myelination
- Increased reflexes
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of the cerebellum
- Epilepsy
- Peripheral neuropathy
- Agenesis of corpus callosum
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the eye
- Clouding of the lens of the eye
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Abnormally small eyeball
- Cerebral visual impairment
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Optic atrophy
- Abnormal retinal pigmentation
- Abnormality of visual evoked potentials
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Permanent flexion of the finger or toe
- Spastic diplegia
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint stiffness
- Low muscle tone
- Hunched back
- Prominent swayback
- Scoliosis
Näytä 3 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RAB3GAP1-geeni: RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rab3gap1
Dante Labs. RAB3GAP1-geeni: RAB3 GTPase activating protein catalytic subunit 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rab3gap1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa