Geen
CHD2
chromodomain helicase DNA binding protein 2
- HGNC 1917↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000173575↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1106↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 15q26.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 15: 92 900 324–93 027 996 (GRCh38)
- Eksonid
- 39 eksonit, ulatus 127,7 kb
- Valk
- 1828 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ38614, DKFZp547I1315, DKFZp781D1727, DKFZp686E01200
- MANE Select transkript
- ENST00000394196.9NM_001271.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CHD2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas CHD2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 9,4 kb kogupikkusega 127,7 kb; neist 5487 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CHD2
257
kohad geenis CHD2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CHD2 127,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseJagab 1 haigust
- ACTL6Bactin like 6BJagab 1 haigust
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Jagab 1 haigust
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Jagab 1 haigust
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 1 haigust
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Jagab 1 haigust
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Jagab 1 haigust
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorJagab 1 haigust
- ARXaristaless related homeoboxJagab 1 haigust
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Jagab 1 haigust
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Jagab 1 haigust
Geeniga CHD2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CHD2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Generalized myoclonic seizure
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Generalized myoclonic-atonic seizure
Näita veel 46 tunnust
- Grand mal seizures
- Abnormal shape of brainstem
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- EEG abnormality
- EEG with generalized polyspikes
- EEG with generalized spikes
- EEG with polyspike wave complexes
- Falls
- Generalized tonic seizure
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Multifocal epileptiform discharges
- Neurodevelopmental delay
- Personality disorder
- Repeated seizures without recovery between them
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Visually-induced seizure
- Abnormal emotional state
- Ataxia
- Brain imaging abnormality
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Interictal epileptiform activity
- Lack of feeling, emotion, interest
- Poor social interactions
- Psychosis
- Seizure affecting one half of brain
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Abnormal pyramidal sign
- Delayed speech and language development
- Epileptic encephalopathy
- Unsteady walk
- Epileptic spasm
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CHD2 geen: chromodomain helicase DNA binding protein 2. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/chd2
Dante Labs. CHD2 geen: chromodomain helicase DNA binding protein 2 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/chd2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast