Gen
CD3E
CD3 epsilon subunit of T-cell receptor complex
- HGNC 1674↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000198851↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 916↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 11q23.3
- Koordinater
- Kromosom 11: 118.304.730–118.316.173 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner fordelt over 11,4 kb
- Protein
- 207 aminosyrer
- Også kendt som
- CD3epsilon, CD3-epsilon
- MANE Select-transkript
- ENST00000361763.9NM_000733.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cd3e.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs CD3E og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Svær kombineret immundefekt
- Autosomal recessiv
Svær kombineret immundefekt (SCID) omfatter en gruppe sjældne monogene primære immundefekt-lidelser, karakteriseret ved mangel på funktionelle perifere T-lymfocytter, hvilket resulterer i tidligt opståede, svære luftvejsinfektioner og manglende vækst. De klassificeres efter immunologisk fænotype i SCID med fravær af T-celler, men tilstedeværelse af B-celler (T-B+ SCID), eller SCID med fravær af både T- og B-celler (T-B- SCID). Begge grupper omfatter flere former, med eller uden naturlige killerceller (NK-celler).
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Immunsvigtsygdom
Et af 170 gener, der er knyttet til det
Sygdom, hvor der er mangel på eller defekt i immunforsvarets mekanismer, enten cellulære eller humorale.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
HSCT ved SCID og alvorlige PID'er; immunglobulinbehandling (IVIG/SCIG) ved antistofmangel; leniolisib (Joenja, FDA 2023) ved APDS; genterapi ved ADA-SCID; abatacept ved CTLA4-/LRBA-mangel; profylaktiske antibiotika; G-CSF ved CGD
Sådan er CD3E opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,4 kb af genets 11,4 kb; 624 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af CD3E
16
positioner i CD3E, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 11,4 kb af CD3E, inklusive introns, og ikke kun de 1,4 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (18)
The CD3E variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 10
- Patogen/sandsynligvis patogen 1
- Sandsynligvis patogen 7
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000733.4(CD3E):c.131_132del (p.Thr44fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000733.4(CD3E):c.103+1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| NM_000733.4(CD3E):c.49+1G>C (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.49+1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.190A>T (p.Lys64Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.261_262del (p.Ser88fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.288T>A (p.Tyr96Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.310A>T (p.Lys104Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.416dup (p.Cys139fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.428del (p.Gly143fs) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.472A>T (p.Lys158Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.490C>T (p.Arg164Ter) (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.71-2A>G (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.86-1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.103+1G>T (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.353-1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.520+1G>A (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
| NM_000733.4(CD3E):c.520+2T>C (opens in a new tab) | immunodeficiency 18 | Sandsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne ud af 4 Kriterier angivet, én indsender |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ADAadenosine deaminaseDeler 2 sygdomme
- AK2adenylate kinase 2Deler 2 sygdomme
- BCL11BBCL11 transcription factor BDeler 2 sygdomme
- CARD11caspase recruitment domain family member 11Deler 2 sygdomme
- CARMIL2capping protein regulator and myosin 1 linker 2Deler 2 sygdomme
- CD247CD247 moleculeDeler 2 sygdomme
- CD3DCD3 delta subunit of T-cell receptor complexDeler 2 sygdomme
- CD70CD70 moleculeDeler 2 sygdomme
- CIITAclass II major histocompatibility complex transactivatorDeler 2 sygdomme
- CORO1Acoronin 1ADeler 2 sygdomme
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDeler 2 sygdomme
- FOXN1forkhead box N1Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til CD3E
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CD3E kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent pneumonia
- Recurrent infections
- Pneumonia
- Recurrent abscess formation
- Recurrent Candida infection
- Red scaly skin caused by inflammatory skin disease
- Susceptibility to herpesvirus
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-18: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.18-8b139e39.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CD3E-genet: CD3 epsilon subunit of T-cell receptor complex. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/cd3e
Dante Labs. CD3E-genet: CD3 epsilon subunit of T-cell receptor complex [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/cd3e
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger