Gen
SNRNP200
small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200
- HGNC 30859↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000144028↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 23020↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2q11.2
- Koordinater
- Kromosom 2: 96 274 338–96 305 546 (GRCh38)
- Exoner
- 45 exoner på 31,2 kb
- Protein
- 2 136 aminosyror
- Även känd som
- U5-200KD, HELIC2, KIAA0788, Brr2
- Tidigare symboler
- ASCC3L1, RP33
- MANE Select-transkript
- ENST00000323853.10NM_014014.5
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/snrnp200.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SNRNP200, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Retinitis pigmentosa
- SNRNP200-relaterad dominant retinopatiAutosomalt dominant
En retinal dystrofi orsakad av förändringar i genen SNRNP200.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
En av 77 gener kopplade till den
En grupp ärftliga retinala dystrofier med progressiv förlust av först stavar och sedan tappar (fotoreceptorer), vilket orsakar nattblindhet och gradvis förlust av perifer syn.
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är SNRNP200 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 7,2 kb av genens 31,2 kb, och 6 411 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SNRNP200
16
positioner i SNRNP200 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 31,2 kb av SNRNP200, inklusive introner, och inte bara de 7,2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Delar 1 tillstånd
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Delar 1 tillstånd
- AHRaryl hydrocarbon receptorDelar 1 tillstånd
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Delar 1 tillstånd
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDelar 1 tillstånd
- ARL3ARF like GTPase 3Delar 1 tillstånd
- ARL6ARF like GTPase 6Delar 1 tillstånd
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Delar 1 tillstånd
- BEST1bestrophin 1Delar 1 tillstånd
- CA4carbonic anhydrase 4Delar 1 tillstånd
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ADelar 1 tillstånd
- CDHR1cadherin related family member 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SNRNP200
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SNRNP200 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
Visa ytterligare 20 egenskaper
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Decreased clarity of vision
- Photopsia
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Rod-cone dystrophy
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SNRNP200-genen: small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/snrnp200
Dante Labs. SNRNP200-genen: small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 200 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/snrnp200
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor