Gen
P4HB
prolyl 4-hydroxylase subunit beta
- HGNC 8548↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000185624↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 5034↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q25.3
- Koordinater
- Kromosom 17: 81 843 166–81 860 535 (GRCh38)
- Exoner
- 11 exoner på 17,4 kb
- Protein
- 508 aminosyror
- Även känd som
- PDIA1, PROHB, DSI, GIT, PDI, PO4HB, P4Hbeta
- Tidigare symboler
- PO4DB, ERBA2L
- MANE Select-transkript
- ENST00000331483.9NM_000918.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/p4hb.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs P4HB, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Osteogenesis imperfecta
En grupp ärftliga bindvävssjukdomar som orsakar sköra ben som lätt bryts, ofta med blå sklera, hörselnedsättning och tandproblem.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Cykliska intravenösa bisfosfonater (pamidronat, zoledronat); ortopedisk märgspikning av långa ben; fysioterapi; denosumab (används kliniskt vid OI hos barn); romosozumab (under utveckling); hörselkontroller; tandvård vid dentinogenesis imperfecta
Så är P4HB uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,4 kb av genens 17,4 kb, och 1 527 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av P4HB
4Lätt
Hur svår P4HB är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i P4HB ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av P4HB:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 15 %.0,7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 10 %.37 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av P4HB:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
1
position i P4HB där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 17,4 kb av P4HB, inklusive introner, inte bara de 2,4 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (1)
The P4HB variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Sannolikt patogen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000918.4(P4HB):c.236dup (p.Leu79fs) (opens in a new tab) | Cole-Carpenter syndrome 1 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ANO5anoctamin 5Delar 1 tillstånd
- ATP6V0A2ATPase H+ transporting V0 subunit a2Delar 1 tillstånd
- BMP1bone morphogenetic protein 1Delar 1 tillstånd
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainDelar 1 tillstånd
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainDelar 1 tillstånd
- CREB3L1cAMP responsive element binding protein 3 like 1Delar 1 tillstånd
- CRTAPcartilage associated proteinDelar 1 tillstånd
- FKBP10FKBP prolyl isomerase 10Delar 1 tillstånd
- GORABgolgin, RAB6 interactingDelar 1 tillstånd
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Delar 1 tillstånd
- IFITM5interferon induced transmembrane protein 5Delar 1 tillstånd
- KDELR2KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till P4HB
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som P4HB kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Compression fracture of a vertebral body
- Low solidness and mass of the bones
- Osteopenia
- Popcorn calcification
- Recurrent fractures
- Scoliosis
- Abnormal skeletal development
- Abnormal vertebral body morphology
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-18: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-8b139e39.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). P4HB-genen: prolyl 4-hydroxylase subunit beta. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/p4hb
Dante Labs. P4HB-genen: prolyl 4-hydroxylase subunit beta [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/p4hb
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor