Gen
TMEM126B
transmembrane protein 126B
- HGNC 30883↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000171204↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 55863↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 11q14.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 85 628 593–85 636 536 (GRCh38)
- Eksoner
- 5 eksoner over 7,9 kb
- Protein
- 230 aminosyrer
- Også kjent som
- HT007
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000358867.11NM_018480.7
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tmem126b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes TMEM126B og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Primær mitokondriesykdom
- Mangel på respirasjonskjede-kompleks
Ett av 61 gener knyttet til den
Isolerte mangler på kompleks I, II, III, IV eller V, forårsaket av varianter i kjerne- eller mitokondriegener. Dette kan påvirke hjernen, musklene, hjertet, leveren og andre organer med høyt energibehov.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Å få vite dette kan avslutte en diagnostisk leting og veilede oppfølging av berørte organer og unngåelse av legemidler som er giftige for mitokondriene.
Slik er TMEM126B bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1 kb av genets 7,9 kb, og 693 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av TMEM126B
1Lav
Hvor vanskelig TMEM126B er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av TMEM126Bs eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.3,7 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.0 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
8
posisjoner i TMEM126B der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 7,9 kb av TMEM126B, inkludert introner, og ikke bare de 1 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Deler 1 tilstand
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaDeler 1 tilstand
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit deltaDeler 1 tilstand
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilonDeler 1 tilstand
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperoneDeler 1 tilstand
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 6Deler 1 tilstand
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 8Deler 1 tilstand
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Deler 1 tilstand
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX15Deler 1 tilstand
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX16Deler 1 tilstand
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX20Deler 1 tilstand
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til TMEM126B
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TMEM126B kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased blood alanine
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Low blood sugar
- Elevated lactate:pyruvate ratio
- High urine lactic acid levels
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). TMEM126B-genet: transmembrane protein 126B. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tmem126b
Dante Labs. TMEM126B-genet: transmembrane protein 126B [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tmem126b
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker