Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

TNFRSF13C

TNF receptor superfamily member 13C

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
22q13.2
Koordinater
Kromosom 22: 41 922 032–41 926 806 (GRCh38)
Eksoner
3 eksoner over 4,8 kb
Protein
184 aminosyrer, 18,9 kDa
Også kjent som
BAFFR, CD268
MANE Select-transkripsjon
ENST00000291232.5NM_052945.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser TNFRSF13C ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er TNFRSF13C bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 22, med en parentes der TNFRSF13C står. TNFRSF13C og 25 gener i nærheten på kromosom 22, fra 41 424 419 til 42 424 418.Kromosom 2222q13.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3341,6 Mb41,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 MbTOB2: 41 433 489–41 447 602, bakover-strengTOB2ACO2: 41 447 830–41 529 273, fremover-strengACO2PHF5A: 41 448 895–41 468 713, bakover-strengPHF5APOLR3H: 41 525 799–41 544 606, bakover-strengPOLR3HCSDC2: 41 560 758–41 577 741, fremover-strengCSDC2PMM1: 41 576 886–41 595 275, bakover-strengPMM1DESI1: 41 598 028–41 621 089, bakover-strengDESI1XRCC6: 41 620 786–41 664 087, fremover-strengXRCC6SNU13: 41 666 627–41 690 504, bakover-strengSNU13MEI1: 41 699 494–41 799 456, fremover-strengMEI1CCDC134: 41 800 321–41 832 178, fremover-strengCCDC134SREBF2: 41 833 029–41 907 308, fremover-strengSREBF2SHISA8: 41 906 316–41 915 129, bakover-strengSHISA8TNFRSF13C: 41 922 032–41 926 806, bakover-strengTNFRSF13CCENPM: 41 927 514–41 947 183, bakover-strengCENPMSMIM45: 41 947 178–41 958 942, fremover-strengSMIM45SEPTIN3: 41 969 443–41 998 221, fremover-strengSEPTIN3WBP2NL: 41 998 725–42 058 456, fremover-strengWBP2NLNAGA: 42 032 595–42 071 198, bakover-strengNAGAPHETA2: 42 073 789–42 079 439, fremover-strengPHETA2SMDT1: 42 079 564–42 090 033, fremover-strengSMDT1NDUFA6: 42 080 336–42 090 884, bakover-strengCYP2D6: 42 120 962–42 131 727, bakover-strengCYP2D6CYP2D7: 42 140 203–42 149 500, bakover-strengCYP2D7TCF20: 42 160 013–42 343 616, bakover-strengTCF20NFAM1: 42 380 407–42 432 425, bakover-strengNFAM1Diagram av TNFRSF13C: 3 eksoner på bakover-strengen til kromosom 22Ekson 2: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 3: 41 922 032–41 925 554, 3 523 baserEkson 2: 41 926 101–41 926 331, 231 baserEkson 1: 41 926 638–41 926 806, 169 baser3215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 3,9 kb av genets 4,8 kb, og 555 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av TNFRSF13C

7Lett

Hvor vanskelig TNFRSF13C er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til TNFRSF13C ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til TNFRSF13C i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0,1 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner12 %
  • GC-innhold16 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

1

posisjon i TNFRSF13C der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen

Ingen av dem ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.

Et helgenomsekvensering dekker alle 4,8 kb av TNFRSF13C, inkludert introner, ikke bare de 3,9 kb med eksoner.

ClinVar-patogene varianter (1)

Variantene i TNFRSF13C som ClinVar klassifiserer som patogene eller sannsynlig patogene for en hvilken som helst tilstand, vurdert av minst én innsender med kriterier, samt de mest vurderte av dem. Dette er ClinVars offentlige oversikt over genet, aldri et resultat.

  • Sannsynligvis patogen 1
VariantTilstanderClinVar-klassifiseringVurderingsstatus
NM_052945.4(TNFRSF13C):c.154G>A (p.Ala52Thr)immunodeficiency, common variable, 4Sannsynligvis patogen1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender

Egenskaper knyttet til TNFRSF13C

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TNFRSF13C kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.21-311f020e.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). TNFRSF13C-genet: TNF receptor superfamily member 13C. Hentet 21. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tnfrsf13c

Vancouver

Dante Labs. TNFRSF13C-genet: TNF receptor superfamily member 13C [Internett]. [sitert 21. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tnfrsf13c

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test