Gen
TSEN54
tRNA splicing endonuclease subunit 54
- HGNC 27561↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000182173↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 283989↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 17q25.1
- Coördinaten
- Chromosoom 17: 75.516.528–75.524.735 (GRCh38)
- Exons
- 11 exons over 8,2 kb
- Eiwit
- 526 aminozuren
- Ook bekend als
- SEN54, SEN54L
- MANE Select-transcript
- ENST00000333213.11NM_207346.3
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees TSEN54 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Spinale Spieratrofie
Een groep aandoeningen die worden gekenmerkt door degeneratie van de voorhoorncellen in het ruggenmerg, wat leidt tot progressieve spierzwakte en spieratrofie.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Genetherapie (onasemnogene abeparvovec), antisense-oligonucleotidetherapie (nusinersen), oraal splicing-modificerend middel (risdiplam), ondersteunende zorg
Opbouw van TSEN54
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,9 kb van de 8,2 kb van het gen; 1.581 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest TSEN54 leest
26
posities in TSEN54 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 8,2 kb van TSEN54, inclusief introns, en niet alleen de 1,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Deelt 1 aandoening
- ATP7AATPase copper transporting alphaDeelt 1 aandoening
- BICD2BICD cargo adaptor 2Deelt 1 aandoening
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinDeelt 1 aandoening
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Deelt 1 aandoening
- DCTN1dynactin subunit 1Deelt 1 aandoening
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Deelt 1 aandoening
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Deelt 1 aandoening
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Deelt 1 aandoening
- EXOSC3exosome component 3Deelt 1 aandoening
- EXOSC8exosome component 8Deelt 1 aandoening
- FBXO38F-box protein 38Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan TSEN54
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TSEN54 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Gliosis
- Hypoplasia of the pons
- Jerking
- Loss of Purkinje cells in the cerebellar vermis
- Small cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Chorea
Toon 26 kenmerken meer
- Choreoathetosis
- Difficulty sleeping
- Dystonia
- Generalized myoclonic seizure
- Hypoplasia of the ventral pons
- Severe global developmental delay
- Infantile spasms
- Motor delay
- Olivopontocerebellar hypoplasia
- Paroxysmal dystonia
- Small brainstem
- Abnormal cortical gyration
- Babinski sign
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dysplastic corpus callosum
- Simple febrile seizure
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Widened cerebellar subarachnoid space
- Cerebellar cyst
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Extrapyramidal dyskinesia
- Infantile encephalopathy
- Restlessness
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TSEN54-gen: tRNA splicing endonuclease subunit 54. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tsen54
Dante Labs. TSEN54-gen: tRNA splicing endonuclease subunit 54 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tsen54
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken