Gen
TSEN54
tRNA splicing endonuclease subunit 54
- HGNC 27561↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000182173↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 283989↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 17q25.1
- Koordinater
- Kromosom 17: 75 516 528–75 524 735 (GRCh38)
- Eksoner
- 11 eksoner over 8,2 kb
- Protein
- 526 aminosyrer
- Også kjent som
- SEN54, SEN54L
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000333213.11NM_207346.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les TSEN54 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Spinal muskelatrofi
En gruppe sykdommer preget av degenerasjon av fremre hornceller i ryggmargen, som fører til progressiv muskelsvakhet og muskelatrofi.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Genterapi (onasemnogen abeparvovec), antisense-oligonukleotidbehandling (nusinersen), oral splicing-modifikator (risdiplam), støttende behandling
Slik er TSEN54 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,9 kb av genets 8,2 kb, og 1 581 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test TSEN54
26
posisjoner i TSEN54 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 8,2 kb av TSEN54, inkludert introner, og ikke bare de 1,9 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Deler 1 tilstand
- ATP7AATPase copper transporting alphaDeler 1 tilstand
- BICD2BICD cargo adaptor 2Deler 1 tilstand
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinDeler 1 tilstand
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Deler 1 tilstand
- DCTN1dynactin subunit 1Deler 1 tilstand
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Deler 1 tilstand
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Deler 1 tilstand
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Deler 1 tilstand
- EXOSC3exosome component 3Deler 1 tilstand
- EXOSC8exosome component 8Deler 1 tilstand
- FBXO38F-box protein 38Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til TSEN54
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TSEN54 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Gliosis
- Hypoplasia of the pons
- Jerking
- Loss of Purkinje cells in the cerebellar vermis
- Small cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Chorea
Vis 26 egenskaper til
- Choreoathetosis
- Difficulty sleeping
- Dystonia
- Generalized myoclonic seizure
- Hypoplasia of the ventral pons
- Severe global developmental delay
- Infantile spasms
- Motor delay
- Olivopontocerebellar hypoplasia
- Paroxysmal dystonia
- Small brainstem
- Abnormal cortical gyration
- Babinski sign
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dysplastic corpus callosum
- Simple febrile seizure
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Widened cerebellar subarachnoid space
- Cerebellar cyst
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Extrapyramidal dyskinesia
- Infantile encephalopathy
- Restlessness
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). TSEN54-genet: tRNA splicing endonuclease subunit 54. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tsen54
Dante Labs. TSEN54-genet: tRNA splicing endonuclease subunit 54 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tsen54
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker