Gen
RXYLT1
ribitol xylosyltransferase 1
- HGNC 13530↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000118600↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10329↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12q14.2
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 63.779.909–63.809.562 (GRCh38)
- Exons
- 6 exons over 29,7 kb
- Eiwit
- 443 aminozuren
- Ook bekend als
- HP10481
- Eerdere symbolen
- TMEM5
- MANE Select-transcript
- ENST00000261234.11NM_014254.3
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rxylt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees RXYLT1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Congenitale spierdystrofieën
- Congenitale spierdystrofie
Een groep spierdystrofieën die bij de geboorte of in de zuigelingenperiode beginnen, waaronder dystroglycanopathieën (zoals vormen die verband houden met FKRP, FKTN en POMT1/2).
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van RXYLT1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,9 kb van de 29,7 kb van het gen; 1.332 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van RXYLT1
12
posities in RXYLT1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 29,7 kb van RXYLT1, inclusief intronen, en niet alleen de 1,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Deelt 1 aandoening
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Deelt 1 aandoening
- CHKBcholine kinase betaDeelt 1 aandoening
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeelt 1 aandoening
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase ADeelt 1 aandoening
- DAG1dystroglycan 1Deelt 1 aandoening
- DOK7docking protein 7Deelt 1 aandoening
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryDeelt 1 aandoening
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan RXYLT1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RXYLT1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Cerebellar dysplasia
- Type II lissencephaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
- Fewer and broader ridges in brain
Toon 12 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RXYLT1-gen: ribitol xylosyltransferase 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/rxylt1
Dante Labs. RXYLT1-gen: ribitol xylosyltransferase 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/rxylt1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken