Geen
RXYLT1
ribitol xylosyltransferase 1
- HGNC 13530↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000118600↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 10329↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 12q14.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 12: 63 779 909–63 809 562 (GRCh38)
- Eksonid
- 6 eksonit, ulatus 29,7 kb
- Valk
- 443 aminohapet
- Tuntud ka kui
- HP10481
- Varasemad tähised
- TMEM5
- MANE Select transkript
- ENST00000261234.11NM_014254.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RXYLT1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Kaasasündinud lihasdüstroofiad
- Kaasasündinud lihasdüstroofia
Lihasdüstroofiate rühm, mis avaldub sünnil või imikueas, sealhulgas düstroglükanopaatiad (nt FKRP-, FKTN- ja POMT1/2-seotud vormid).
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas RXYLT1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 29,7 kb; neist 1332 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RXYLT1
12
kohad geenis RXYLT1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RXYLT1 29,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Jagab 1 haigust
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Jagab 1 haigust
- CHKBcholine kinase betaJagab 1 haigust
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainJagab 1 haigust
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainJagab 1 haigust
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainJagab 1 haigust
- CRPPACDP-L-ribitol pyrophosphorylase AJagab 1 haigust
- DAG1dystroglycan 1Jagab 1 haigust
- DOK7docking protein 7Jagab 1 haigust
- DPM2dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 2, regulatoryJagab 1 haigust
- DPM3dolichyl-phosphate mannosyltransferase subunit 3, regulatoryJagab 1 haigust
Geeniga RXYLT1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RXYLT1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Cerebellar dysplasia
- Type II lissencephaly
- Abnormal cerebellar vermis morphology
- Abnormal cortical gyration
- Abnormality of neuronal migration
- Absent reflexes
- Decreased reflex response
- Fewer and broader ridges in brain
Näita veel 12 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RXYLT1 geen: ribitol xylosyltransferase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rxylt1
Dante Labs. RXYLT1 geen: ribitol xylosyltransferase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rxylt1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast