Genas
OTOF
otoferlin
- HGNC 8515↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000115155↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 9381↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 2p23.3
- Koordinatės
- Chromosoma 2: 26 457 203–26 558 756 (GRCh38)
- Eksonai
- 47 eksonų per 101,6 kb
- Baltymas
- 1 997 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- FER1L2, DFNB6
- Ankstesni simboliai
- DFNB9
- MANE Select transkriptas
- ENST00000272371.7NM_194248.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite OTOF ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Klausos ir kurtumas
- Auditorinė neuropatija
Klausos netekimas, kai vidinė ausis suvokia garsą, bet signalas į klausos nervą neperduodamas įprastai; tai apima paveldimas formas, kurias sukelia OTOF ir kiti genai.
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Priežasties nustatymas gali turėti įtakos pasirinkimui tarp klausos aparatų ir kochlearinių implantų, o su OTOF susijusios formos yra genų terapijos tyrimų objektas.
- Nesindrominė paveldima klausos netekimas
Vienas iš 97 su juo susijusių genų
Paveldimas klausos netekimas be kitų medicininių požymių, įskaitant dažniausias recesyvines formas, kurias sukelia GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ir daugelis kitų genų, taip pat dominantines, X chromosomai susietas ir mitochondrines formas.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Žinojimas apie genetinę priežastį gali padėti priimti sprendimus dėl klausos pagalbos ir kochlearinio implanto, nustatyti tinkamumą genų terapijos tyrimams (pavyzdžiui, OTOF) bei suteikti konsultacijas šeimai.
Kaip išdėstytas OTOF
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 7,2 kb iš 101,6 kb geno; 5 994 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito OTOF
164
OTOF geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 101,6 kb OTOF geno, įskaitant intronus, o ne tik 7,2 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (7)
Čia pateikiami OTOF variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2215-1G>C | Intronas 18 | 26 477 750 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.5193-1G>A | Intronas 41 | 26 462 182 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| E1700Q | c.5098G>C | Eksonas 40 | 26 463 969 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| Q829X | c.2485C>T | Eksonas 21 | 26 477 210 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| R708X | c.2122C>T | Eksonas 18 | 26 479 356 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| R1583H | c.4748G>A | Eksonas 38 | 26 465 723 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| R1792C | c.5374C>T | Eksonas 43 | 26 461 855 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Turi 2 bendrų būklių
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ATuri 2 bendrų būklių
- ACTG1actin gamma 1Turi 1 bendrą būklę
- AFG2BAAA ATPase AFG2BTuri 1 bendrą būklę
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Turi 1 bendrą būklę
- CABP2calcium binding protein 2Turi 1 bendrą būklę
- CD164CD164 moleculeTuri 1 bendrą būklę
- CDC14Acell division cycle 14ATuri 1 bendrą būklę
- CDH23cadherin related 23Turi 1 bendrą būklę
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentTuri 1 bendrą būklę
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Turi 1 bendrą būklę
- CLDN14claudin 14Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su OTOF
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti OTOF, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). OTOF genas: otoferlin. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/otof
Dante Labs. OTOF genas: otoferlin [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/otof
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites