Gen
OTOF
otoferlin
- HGNC 8515↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000115155↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 9381↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p23.3
- Koordinater
- Kromosom 2: 26.457.203–26.558.756 (GRCh38)
- Exoner
- 47 exoner fordelt over 101,6 kb
- Protein
- 1.997 aminosyrer
- Også kendt som
- FER1L2, DFNB6
- Tidligere symboler
- DFNB9
- MANE Select-transkript
- ENST00000272371.7NM_194248.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs OTOF og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Høretab og døvhed
- Auditiv neuropati
Høretab, hvor det indre øre registrerer lyd, men signalet ikke videregives normalt til hørenerven, herunder arvelige former forårsaget af OTOF og andre gener.
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Kendskab til årsagen kan påvirke valget mellem høreapparat og cochleaimplantat, og OTOF-relaterede former er genstand for genterapiforsøg.
- Ikke-syndromal genetisk høretab
Et af 97 gener, der er knyttet til det
Arvelig høretab uden andre medicinske træk, herunder de hyppige recessive former forårsaget af GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC og mange andre gener, samt dominante, X-bundne og mitokondrielle former.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden om den genetiske årsag kan vejlede valget af høreapparat og cochleaimplantat, berettigelse til genterapiforsøg (for eksempel OTOF) og familierådgivning.
Sådan er OTOF opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 7,2 kb af genets 101,6 kb; 5.994 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest OTOF
164
positioner i OTOF, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 101,6 kb af OTOF, inklusive introner, og ikke kun de 7,2 kb eksoner.
Varianter med en side (7)
Her vises de OTOF-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2215-1G>C | Intron 18 | 26.477.750 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.5193-1G>A | Intron 41 | 26.462.182 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| E1700Q | c.5098G>C | Exon 40 | 26.463.969 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| Q829X | c.2485C>T | Exon 21 | 26.477.210 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R708X | c.2122C>T | Exon 18 | 26.479.356 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R1583H | c.4748G>A | Exon 38 | 26.465.723 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R1792C | c.5374C>T | Exon 43 | 26.461.855 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deler 2 sygdomme
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeler 2 sygdomme
- ACTG1actin gamma 1Deler 1 sygdom
- AFG2BAAA ATPase AFG2BDeler 1 sygdom
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deler 1 sygdom
- CABP2calcium binding protein 2Deler 1 sygdom
- CD164CD164 moleculeDeler 1 sygdom
- CDC14Acell division cycle 14ADeler 1 sygdom
- CDH23cadherin related 23Deler 1 sygdom
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeler 1 sygdom
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Deler 1 sygdom
- CLDN14claudin 14Deler 1 sygdom
Træk knyttet til OTOF
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, OTOF kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). OTOF-genet: otoferlin. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/otof
Dante Labs. OTOF-genet: otoferlin [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/otof
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger