Gen
OTOF
otoferlin
- HGNC 8515↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000115155↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 9381↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2p23.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 26.457.203–26.558.756 (GRCh38)
- Exons
- 47 exons over 101,6 kb
- Eiwit
- 1.997 aminozuren
- Ook bekend als
- FER1L2, DFNB6
- Eerdere symbolen
- DFNB9
- MANE Select-transcript
- ENST00000272371.7NM_194248.3
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/otof.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees OTOF en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Gehoorverlies en doofheid
- Auditieve neuropathie
Gehoorverlies waarbij het binnenoor geluid waarneemt, maar het signaal niet normaal wordt doorgegeven aan de gehoorzenuw, inclusief erfelijke vormen veroorzaakt door OTOF en andere genen.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het vaststellen van de oorzaak kan invloed hebben op de keuze tussen hoortoestellen en cochleaire implantaten, en vormen die met OTOF samenhangen, zijn onderwerp van onderzoeken naar genetherapie.
- Niet-syndromale erfelijke gehoorstoornis
Een van 97 genen die hiermee verband houden
Erfelijk gehoorverlies zonder andere medische kenmerken, inclusief de veelvoorkomende recessieve vormen veroorzaakt door GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC en vele andere genen, evenals dominante, X-gebonden en mitochondriale vormen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de genetische oorzaak kan helpen bij keuzes rond gehoorondersteuning en cochleaire implantaten, bij de geschiktheid voor deelname aan onderzoeken naar genetherapie (bijvoorbeeld bij OTOF) en bij erfelijkheidsadvies voor familieleden.
Opbouw van OTOF
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,2 kb van de 101,6 kb van het gen; 5.994 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van OTOF
164
posities in OTOF waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 101,6 kb van OTOF, inclusief intronen, en niet alleen de 7,2 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (7)
De OTOF-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2215-1G>C | Intron 18 | 26.477.750 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.5193-1G>A | Intron 41 | 26.462.182 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| E1700Q | c.5098G>C | Exon 40 | 26.463.969 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| Q829X | c.2485C>T | Exon 21 | 26.477.210 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R708X | c.2122C>T | Exon 18 | 26.479.356 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R1583H | c.4748G>A | Exon 38 | 26.465.723 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R1792C | c.5374C>T | Exon 43 | 26.461.855 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deelt 2 aandoeningen
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeelt 2 aandoeningen
- ACTG1actin gamma 1Deelt 1 aandoening
- AFG2BAAA ATPase AFG2BDeelt 1 aandoening
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deelt 1 aandoening
- CABP2calcium binding protein 2Deelt 1 aandoening
- CD164CD164 moleculeDeelt 1 aandoening
- CDC14Acell division cycle 14ADeelt 1 aandoening
- CDH23cadherin related 23Deelt 1 aandoening
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeelt 1 aandoening
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Deelt 1 aandoening
- CLDN14claudin 14Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan OTOF
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die OTOF kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). OTOF-gen: otoferlin. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/otof
Dante Labs. OTOF-gen: otoferlin [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/otof
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken