Gen
OTOF
otoferlin
- HGNC 8515↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000115155↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 9381↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2p23.3
- Współrzędne
- Chromosom 2: 26 457 203–26 558 756 (GRCh38)
- Eksony
- 47 eksonów na odcinku 101,6 kb
- Białko
- 1997 aminokwasów
- Znany również jako
- FER1L2, DFNB6
- Poprzednie symbole
- DFNB9
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000272371.7NM_194248.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj OTOF oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Utrata słuchu i głuchota
- Neuropatia słuchu
Utrata słuchu, w której ucho wewnętrzne wykrywa dźwięk, ale sygnał nie jest prawidłowo przekazywany do nerwu słuchowego; obejmuje dziedziczne postacie wywołane przez OTOF i inne geny.
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Ustalenie przyczyny może wpływać na wybór między aparatem słuchowym a implantem ślimakowym, a postacie związane z OTOF są przedmiotem badań nad terapią genową.
- Niezespołowa genetyczna utrata słuchu
Jeden z 97 powiązanych z nim genów
Dziedziczna utrata słuchu bez innych objawów medycznych, obejmująca częste recesywne postacie wywoływane przez GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC i wiele innych genów, a także postacie dominujące, sprzężone z chromosomem X oraz mitochondrialne.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Znajomość genetycznej przyczyny może pomóc w wyborze wsparcia słuchowego i decyzji dotyczących implantu ślimakowego, kwalifikacji do badań terapii genowych (na przykład w przypadku OTOF) oraz poradnictwa rodzinnego.
Budowa genu OTOF
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 7,2 kb z 101,6 kb genu; 5994 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje OTOF
164
pozycje w OTOF, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 101,6 kb genu OTOF, łącznie z intronami, a nie tylko 7,2 kb eksonów.
Warianty z podstroną (7)
Warianty OTOF z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| c.2215-1G>C | Intron 18 | 26 477 750 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.5193-1G>A | Intron 41 | 26 462 182 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| E1700Q | c.5098G>C | Ekson 40 | 26 463 969 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| Q829X | c.2485C>T | Ekson 21 | 26 477 210 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R708X | c.2122C>T | Ekson 18 | 26 479 356 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R1583H | c.4748G>A | Ekson 38 | 26 465 723 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R1792C | c.5374C>T | Ekson 43 | 26 461 855 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Wspólnych schorzeń: 2
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AWspólnych schorzeń: 2
- ACTG1actin gamma 1Wspólne schorzenie: 1
- AFG2BAAA ATPase AFG2BWspólne schorzenie: 1
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Wspólne schorzenie: 1
- CABP2calcium binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- CD164CD164 moleculeWspólne schorzenie: 1
- CDC14Acell division cycle 14AWspólne schorzenie: 1
- CDH23cadherin related 23Wspólne schorzenie: 1
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentWspólne schorzenie: 1
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Wspólne schorzenie: 1
- CLDN14claudin 14Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem OTOF
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać OTOF. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen OTOF: otoferlin. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/otof
Dante Labs. Gen OTOF: otoferlin [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/otof
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni