Gene
RP1
RP1 axonemal microtubule associated
- HGNC 10263↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000104237↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6101↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 8q11.23-q12.1
- Coordinate
- Cromosoma 8: 54.616.096–54.630.834 (GRCh38)
- Esoni
- 4 esoni su 14,7 kb
- Proteina
- 2156 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante Autosomica recessiva
- Noto anche come
- DCDC4A, ORP1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000220676.2NM_006269.2
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Retinite pigmentosa
- Retinopatia recessiva correlata a RP1Autosomica recessiva
Una distrofia retinica causata da alterazioni del gene RP1.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Retinopatia dominante correlata a RP1Autosomica dominante
Una distrofia retinica causata da alterazioni del gene RP1.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Uno di 77 geni collegati ad esso
Un gruppo di distrofie retiniche ereditarie caratterizzate dalla progressiva perdita dei fotorecettori a bastoncello e, successivamente, dei coni, che causa cecità notturna e una graduale perdita della visione periferica.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di RP1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 7,1 kb dei 14,7 kb del gene; 6471 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge RP1
134
posizioni in RP1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 14,7 kb di RP1, introni inclusi, non solo i 7,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Condivide 1 condizione
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Condivide 1 condizione
- AHRaryl hydrocarbon receptorCondivide 1 condizione
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Condivide 1 condizione
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinCondivide 1 condizione
- ARL3ARF like GTPase 3Condivide 1 condizione
- ARL6ARF like GTPase 6Condivide 1 condizione
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Condivide 1 condizione
- BEST1bestrophin 1Condivide 1 condizione
- CA4carbonic anhydrase 4Condivide 1 condizione
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ACondivide 1 condizione
- CDHR1cadherin related family member 1Condivide 1 condizione
Tratti collegati a RP1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che RP1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the eye
- Limited peripheral vision
- Optic disc pallor
- Spicular pigmentation of the retina
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
Mostra altri 23 tratti
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Blind spot
- Photopsia
- Close sighted
- Rod-cone dystrophy
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene RP1: RP1 axonemal microtubule associated. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/rp1
Dante Labs. Gene RP1: RP1 axonemal microtubule associated [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/rp1
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