Gene
ATF6
activating transcription factor 6
- HGNC 791↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000118217↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 22926↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1q23.3
- Coordinate
- Cromosoma 1: 161.766.320–161.964.070 (GRCh38)
- Esoni
- 16 esoni su 197,8 kb
- Proteina
- 670 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- ATF6A, ATP6alpha
- Trascritto MANE Select
- ENST00000367942.4NM_007348.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Acromatopsia
- Retinopatia correlata a ATF6Autosomica recessiva
Un disturbo dei coni causato da alterazioni in entrambe le copie di ATF6.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
L'acromatopsia (ACHM) è una rara malattia retinica autosomica recessiva caratterizzata da cecità ai colori, nistagmo, fotofobia e una grave riduzione dell'acutezza visiva, dovuta all'assenza o alla compromissione della funzione dei coni.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di ATF6
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 7,5 kb dei 197,8 kb del gene; 2013 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge ATF6
18
posizioni in ATF6 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 197,8 kb di ATF6, introni inclusi, non solo i 7,5 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- CNGA3cyclic nucleotide gated channel subunit alpha 3Condivide 1 condizione
- CNGB3cyclic nucleotide gated channel subunit beta 3Condivide 1 condizione
- GNAT2G protein subunit alpha transducin 2Condivide 1 condizione
- OPN1LWopsin 1, long wave sensitiveCondivide 1 condizione
- OPN1MWopsin 1, medium wave sensitiveCondivide 1 condizione
- PDE6Hphosphodiesterase 6HCondivide 1 condizione
Tratti collegati a ATF6
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che ATF6 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Abnormal color vision
- Abnormal retinal pigmentation
- Abnormality of refraction
- Achromatopsia
- Color vision test abnormality
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
Mostra altri 24 tratti
- Hypoplasia of the fovea
- Inner retinal layer loss on macular OCT
- Macular atrophy
- Pendular nystagmus
- Total colorblindness
- Undetectable light-adapted electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Absent foveal reflex
- Blind spot located at fixation point
- Close sighted
- Color blindness
- Farsightedness
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Eccentric visual fixation
- Metamorphopsia
- Retinal pigment epithelial mottling
- Visual impairment
- Retinal pigment epithelial atrophy
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene ATF6: activating transcription factor 6. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/atf6
Dante Labs. Gene ATF6: activating transcription factor 6 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/atf6
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