Geeni
ATF6
activating transcription factor 6
- HGNC 791↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000118217↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 22926↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q23.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 161 766 320–161 964 070 (GRCh38)
- Eksonit
- 16 eksonia 197,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 670 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- ATF6A, ATP6alpha
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367942.4NM_007348.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue ATF6 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Akromatopsia
- ATF6-geeniin liittyvä retinopatiaAutosomaalinen resessiivinen
Tappien toimintahäiriö, joka johtuu ATF6-geenin molempien kopioiden muutoksista.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Akromatopsia (ACHM) on harvinainen autosomaalisesti resessiivisesti periytyvä verkkokalvon sairaus. Sille ovat ominaisia värisokeus, nystagmus, valoarkuus ja huomattava näöntarkkuuden heikkeneminen, jotka johtuvat tappisolujen toiminnan puuttumisesta tai heikentymisestä.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
ATF6-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 7,5 kb geenin 197,8 kb:stä; 2 013 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä ATF6
18
ATF6-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 197,8 kb geenistä ATF6, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 7,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CNGA3cyclic nucleotide gated channel subunit alpha 3Yhteinen sairaus: 1
- CNGB3cyclic nucleotide gated channel subunit beta 3Yhteinen sairaus: 1
- GNAT2G protein subunit alpha transducin 2Yhteinen sairaus: 1
- OPN1LWopsin 1, long wave sensitiveYhteinen sairaus: 1
- OPN1MWopsin 1, medium wave sensitiveYhteinen sairaus: 1
- PDE6Hphosphodiesterase 6HYhteinen sairaus: 1
Geeniin ATF6 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita ATF6 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Abnormal color vision
- Abnormal retinal pigmentation
- Abnormality of refraction
- Achromatopsia
- Color vision test abnormality
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
Näytä 24 piirrettä lisää
- Hypoplasia of the fovea
- Inner retinal layer loss on macular OCT
- Macular atrophy
- Pendular nystagmus
- Total colorblindness
- Undetectable light-adapted electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Absent foveal reflex
- Blind spot located at fixation point
- Close sighted
- Color blindness
- Farsightedness
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic disc pallor
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Abnormal macular morphology
- Abnormal pupillary light reflex
- Eccentric visual fixation
- Metamorphopsia
- Retinal pigment epithelial mottling
- Visual impairment
- Retinal pigment epithelial atrophy
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ATF6-geeni: activating transcription factor 6. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/atf6
Dante Labs. ATF6-geeni: activating transcription factor 6 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/atf6
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa