Gén
VWA8
von Willebrand factor A domain containing 8
- HGNC 29071↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000102763↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 23078↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 13q14.11
- Koordináták
- 13. kromoszóma: 41 566 835–41 961 109 (GRCh38)
- Exonok
- 45 exon, összesen 394,3 kb
- Fehérje
- 1905 aminosav
- Más néven ismert
- P7BP2
- Korábbi jelölések
- KIAA0564
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000379310.8NM_015058.2
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/vwa8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a VWA8-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Retinitis Pigmentosa
A 77 hozzá kapcsolódó gén egyike
A group of inherited retinal dystrophies with progressive loss of rod and then cone photoreceptors, causing night blindness and gradual loss of peripheral vision.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A VWA8 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 394,3 kb-jából 7,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5718 bázis kódolja a fehérjét.
VWA8 szekvenálása
2Könnyű
Mennyire nehéz a VWA8 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A VWA8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a VWA8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0,1%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.1,3%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.6,1%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a VWA8 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 41 betegséget oszt meg
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 51 betegséget oszt meg
- AHRaryl hydrocarbon receptor1 betegséget oszt meg
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 181 betegséget oszt meg
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding protein1 betegséget oszt meg
- ARL3ARF like GTPase 31 betegséget oszt meg
- ARL6ARF like GTPase 61 betegséget oszt meg
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 21 betegséget oszt meg
- BEST1bestrophin 11 betegséget oszt meg
- CA4carbonic anhydrase 41 betegséget oszt meg
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2A1 betegséget oszt meg
- CDHR1cadherin related family member 11 betegséget oszt meg
A(z) VWA8 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) VWA8 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). VWA8 gén: von Willebrand factor A domain containing 8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/vwa8
Dante Labs. VWA8 gén: von Willebrand factor A domain containing 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/vwa8
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt