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Gène

VIPAS39

VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog

Résumé

Localisation cytogénétique
14q24.3
Coordonnées
Chromosome 14 : 77 426 675–77 457 601 (GRCh38)
Exons
20 exons sur 30,9 kb
Protéine
493 acides aminés
Aussi appelé
VIPAR, VPS16B, SPE-39, SPE39, hSPE-39
Symboles précédents
C14orf133
Transcrit MANE Select
ENST00000557658.6NM_001193315.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore VIPAS39. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de VIPAS39

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de VIPAS39. VIPAS39 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 76 942 138 à 77 942 137.Chromosome 1414q24.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3377 Mb77,2 Mb77,4 Mb77,6 Mb77,8 MbIRF2BPL : 77 024 543–77 028 708, brin inverseIRF2BPLCIPC : 77 098 126–77 117 287, brin directCIPC : 77 098 311–77 225 462, brin directTMEM63C : 77 116 568–77 259 498, brin directTMEM63CZDHHC22 : 77 131 266–77 143 032, brin inverseZDHHC22NGB : 77 265 483–77 271 211, brin inverseNGBPOMT2 : 77 274 956–77 320 898, brin inversePOMT2GSTZ1 : 77 320 996–77 344 021, brin directGSTZ1TMED8 : 77 335 024–77 377 348, brin inverseTMED8SAMD15 : 77 376 689–77 392 372, brin directSAMD15NOXRED1 : 77 394 021–77 423 523, brin inverseNOXRED1VIPAS39 : 77 426 675–77 457 601, brin inverseVIPAS39AHSA1 : 77 457 743–77 469 482, brin directAHSA1ISM2 : 77 474 394–77 499 408, brin inverseISM2SPTLC2 : 77 505 997–77 616 781, brin inverseSPTLC2ALKBH1 : 77 672 401–77 708 038, brin inverseALKBH1SLIRP : 77 708 045–77 761 104, brin directSLIRPSNW1 : 77 709 019–77 761 207, brin inverseSNW1ADCK1 : 77 800 059–77 937 188, brin directADCK1Schéma de VIPAS39 : 20 exons sur le brin inverse du chromosome 14Exon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 20 : 77 426 675–77 427 636, 962 basesExon 19 : 77 428 370–77 428 474, 105 basesExon 18 : 77 429 006–77 429 095, 90 basesExon 17 : 77 429 681–77 429 767, 87 basesExon 16 : 77 433 842–77 433 931, 90 basesExon 15 : 77 434 262–77 434 303, 42 basesExon 14 : 77 435 259–77 435 393, 135 basesExon 13 : 77 435 844–77 435 919, 76 basesExon 12 : 77 437 808–77 437 881, 74 basesExon 11 : 77 441 066–77 441 093, 28 basesExon 10 : 77 442 560–77 442 662, 103 basesExon 9 : 77 443 119–77 443 152, 34 basesExon 8 : 77 444 249–77 444 341, 93 basesExon 7 : 77 448 494–77 448 550, 57 basesExon 6 : 77 449 293–77 449 357, 65 basesExon 5 : 77 449 714–77 449 752, 39 basesExon 4 : 77 451 187–77 451 333, 147 basesExon 3 : 77 453 299–77 453 401, 103 basesExon 2 : 77 454 010–77 454 102, 93 basesExon 1 : 77 457 495–77 457 601, 107 bases201816141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,5 kb sur les 30,9 kb du gène ; 1 482 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit VIPAS39

11

positions dans VIPAS39 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 30,9 kb de VIPAS39, introns compris, et pas seulement les 2,5 kb d'exons.

Traits associés à VIPAS39

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que VIPAS39 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène VIPAS39 : VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vipas39

Vancouver

Dante Labs. Gène VIPAS39 : VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vipas39

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