Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

VIPAS39

VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
14q24.3
Koordinaadid
Kromosoom 14: 77 426 675–77 457 601 (GRCh38)
Eksonid
20 eksonit, ulatus 30,9 kb
Valk
493 aminohapet
Tuntud ka kui
VIPAR, VPS16B, SPE-39, SPE39, hSPE-39
Varasemad tähised
C14orf133
MANE Select transkript
ENST00000557658.6NM_001193315.2
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni VIPAS39 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas VIPAS39 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 14, millel on sulg kohal, kus asub VIPAS39. VIPAS39 ja sellele lähedal asuvad 18 geeni kromosoomil 14, vahemikus 76 942 138 kuni 77 942 137.Kromosoom 1414q24.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3377 Mb77,2 Mb77,4 Mb77,6 Mb77,8 MbIRF2BPL: 77 024 543–77 028 708, pöördne ahelIRF2BPLCIPC: 77 098 126–77 117 287, otsene ahelCIPC: 77 098 311–77 225 462, otsene ahelTMEM63C: 77 116 568–77 259 498, otsene ahelTMEM63CZDHHC22: 77 131 266–77 143 032, pöördne ahelZDHHC22NGB: 77 265 483–77 271 211, pöördne ahelNGBPOMT2: 77 274 956–77 320 898, pöördne ahelPOMT2GSTZ1: 77 320 996–77 344 021, otsene ahelGSTZ1TMED8: 77 335 024–77 377 348, pöördne ahelTMED8SAMD15: 77 376 689–77 392 372, otsene ahelSAMD15NOXRED1: 77 394 021–77 423 523, pöördne ahelNOXRED1VIPAS39: 77 426 675–77 457 601, pöördne ahelVIPAS39AHSA1: 77 457 743–77 469 482, otsene ahelAHSA1ISM2: 77 474 394–77 499 408, pöördne ahelISM2SPTLC2: 77 505 997–77 616 781, pöördne ahelSPTLC2ALKBH1: 77 672 401–77 708 038, pöördne ahelALKBH1SLIRP: 77 708 045–77 761 104, otsene ahelSLIRPSNW1: 77 709 019–77 761 207, pöördne ahelSNW1ADCK1: 77 800 059–77 937 188, otsene ahelADCK1VIPAS39 skeem: 20 eksonit kromosoomi 14 pöördne ahelalEkson 14: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 12: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 20: 77 426 675–77 427 636, 962 alustEkson 19: 77 428 370–77 428 474, 105 alustEkson 18: 77 429 006–77 429 095, 90 alustEkson 17: 77 429 681–77 429 767, 87 alustEkson 16: 77 433 842–77 433 931, 90 alustEkson 15: 77 434 262–77 434 303, 42 alustEkson 14: 77 435 259–77 435 393, 135 alustEkson 13: 77 435 844–77 435 919, 76 alustEkson 12: 77 437 808–77 437 881, 74 alustEkson 11: 77 441 066–77 441 093, 28 alustEkson 10: 77 442 560–77 442 662, 103 alustEkson 9: 77 443 119–77 443 152, 34 alustEkson 8: 77 444 249–77 444 341, 93 alustEkson 7: 77 448 494–77 448 550, 57 alustEkson 6: 77 449 293–77 449 357, 65 alustEkson 5: 77 449 714–77 449 752, 39 alustEkson 4: 77 451 187–77 451 333, 147 alustEkson 3: 77 453 299–77 453 401, 103 alustEkson 2: 77 454 010–77 454 102, 93 alustEkson 1: 77 457 495–77 457 601, 107 alust201816141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 30,9 kb; neist 1482 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse VIPAS39

11

kohad geenis VIPAS39, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni VIPAS39 30,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). VIPAS39 geen: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vipas39

Vancouver

Dante Labs. VIPAS39 geen: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vipas39

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test