Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

VIPAS39

VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
14q24.3
Koordinaatit
Kromosomi 14: 77 426 675–77 457 601 (GRCh38)
Eksonit
20 eksonia 30,9 kb:n alueella
Proteiini
493 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
VIPAR, VPS16B, SPE-39, SPE39, hSPE-39
Aiemmat symbolit
C14orf133
MANE Select -transkripti
ENST00000557658.6NM_001193315.2
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä VIPAS39. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

VIPAS39-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 14, jossa hakasulke osoittaa VIPAS39-geenin sijainnin. VIPAS39 ja 18 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 14, välillä 76 942 138–77 942 137.Kromosomi 1414q24.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3377 Mb77,2 Mb77,4 Mb77,6 Mb77,8 MbIRF2BPL: 77 024 543–77 028 708, juoste taaksepäinIRF2BPLCIPC: 77 098 126–77 117 287, juoste eteenpäinCIPC: 77 098 311–77 225 462, juoste eteenpäinTMEM63C: 77 116 568–77 259 498, juoste eteenpäinTMEM63CZDHHC22: 77 131 266–77 143 032, juoste taaksepäinZDHHC22NGB: 77 265 483–77 271 211, juoste taaksepäinNGBPOMT2: 77 274 956–77 320 898, juoste taaksepäinPOMT2GSTZ1: 77 320 996–77 344 021, juoste eteenpäinGSTZ1TMED8: 77 335 024–77 377 348, juoste taaksepäinTMED8SAMD15: 77 376 689–77 392 372, juoste eteenpäinSAMD15NOXRED1: 77 394 021–77 423 523, juoste taaksepäinNOXRED1VIPAS39: 77 426 675–77 457 601, juoste taaksepäinVIPAS39AHSA1: 77 457 743–77 469 482, juoste eteenpäinAHSA1ISM2: 77 474 394–77 499 408, juoste taaksepäinISM2SPTLC2: 77 505 997–77 616 781, juoste taaksepäinSPTLC2ALKBH1: 77 672 401–77 708 038, juoste taaksepäinALKBH1SLIRP: 77 708 045–77 761 104, juoste eteenpäinSLIRPSNW1: 77 709 019–77 761 207, juoste taaksepäinSNW1ADCK1: 77 800 059–77 937 188, juoste eteenpäinADCK1VIPAS39-kaavio: 20 eksonia kromosomin 14 juosteella, taaksepäinEksoni 14: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 12: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 10: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 9: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 7: 2 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEksoni 3: 2 tunnettua tautia aiheuttavaa kohtaaEkson 20: 77 426 675–77 427 636, 962 emästäEkson 19: 77 428 370–77 428 474, 105 emästäEkson 18: 77 429 006–77 429 095, 90 emästäEkson 17: 77 429 681–77 429 767, 87 emästäEkson 16: 77 433 842–77 433 931, 90 emästäEkson 15: 77 434 262–77 434 303, 42 emästäEkson 14: 77 435 259–77 435 393, 135 emästäEkson 13: 77 435 844–77 435 919, 76 emästäEkson 12: 77 437 808–77 437 881, 74 emästäEkson 11: 77 441 066–77 441 093, 28 emästäEkson 10: 77 442 560–77 442 662, 103 emästäEkson 9: 77 443 119–77 443 152, 34 emästäEkson 8: 77 444 249–77 444 341, 93 emästäEkson 7: 77 448 494–77 448 550, 57 emästäEkson 6: 77 449 293–77 449 357, 65 emästäEkson 5: 77 449 714–77 449 752, 39 emästäEkson 4: 77 451 187–77 451 333, 147 emästäEkson 3: 77 453 299–77 453 401, 103 emästäEkson 2: 77 454 010–77 454 102, 93 emästäEkson 1: 77 457 495–77 457 601, 107 emästä201816141210864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 30,9 kb:stä; 1 482 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä VIPAS39

11

VIPAS39-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 30,9 kb geenistä VIPAS39, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,5 kb eksoneja.

Geeniin VIPAS39 liittyvät piirteet

Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita VIPAS39 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

Ulkoiset linkit

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). VIPAS39-geeni: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vipas39

Vancouver

Dante Labs. VIPAS39-geeni: VPS33B interacting protein, apical-basolateral polarity regulator, spe-39 homolog [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vipas39

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test