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Gène

GLYCTK

glycerate kinase

Résumé

Localisation cytogénétique
3p21.2
Coordonnées
Chromosome 3 : 52 287 828–52 295 257 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 7,4 kb
Protéine
523 acides aminés
Aussi appelé
HBEBP4, HBEBP2
Transcrit MANE Select
ENST00000436784.7NM_145262.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GLYCTK. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GLYCTK

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de GLYCTK. GLYCTK et 37 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 51 791 543 à 52 791 542.Chromosome 33p21.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2951,8 Mb52 Mb52,2 Mb52,4 Mb52,6 Mb : 51 798 803–51 830 856, brin directIQCF1 : 51 809 295–51 903 369, brin inverseIQCF1IQCF3 : 51 826 883–51 833 389, brin directIQCF3IQCF2 : 51 861 615–51 863 424, brin directIQCF2IQCF5 : 51 873 721–51 875 601, brin inverseIQCF5RRP9 : 51 933 425–51 941 946, brin inversePARP3 : 51 942 252–51 949 371, brin directGPR62 : 51 955 381–51 957 499, brin directPCBP4 : 51 957 448–51 974 630, brin inverseABHD14B : 51 968 510–51 983 409, brin inverseABHD14A : 51 971 426–51 982 398, brin directABHD14AABHD14A-ACY1 : 51 974 706–51 989 183, brin directABHD14A-ACY1ACY1 : 51 983 047–51 989 457, brin directACY1RPL29 : 51 993 522–51 996 021, brin inverseRPL29DUSP7 : 52 048 919–52 056 577, brin inverseDUSP7POC1A : 52 074 590–52 154 746, brin inversePOC1AALAS1 : 52 198 085–52 214 620, brin directTLR9 : 52 221 080–52 225 651, brin inverseTLR9 : 52 221 081–52 231 190, brin inverseTWF2 : 52 228 612–52 246 788, brin inverseTWF2PPM1M : 52 245 741–52 250 616, brin directPPM1MWDR82 : 52 254 434–52 288 020, brin inverseWDR82GLYCTK : 52 287 828–52 295 257, brin directGLYCTKDNAH1 : 52 316 319–52 400 492, brin directDNAH1BAP1 : 52 398 585–52 410 038, brin inverseBAP1PHF7 : 52 410 504–52 427 966, brin directPHF7SEMA3G : 52 433 035–52 445 103, brin inverseSEMA3GTNNC1 : 52 451 082–52 454 071, brin inverseTNNC1NISCH : 52 455 118–52 493 081, brin directNISCHSTAB1 : 52 495 331–52 524 512, brin directSTAB1NT5DC2 : 52 524 369–52 535 093, brin inverseNT5DC2UQCC5 : 52 533 950–52 579 237, brin directUQCC5PBRM1 : 52 544 271–52 685 979, brin inversePBRM1GNL3 : 52 681 156–52 696 160, brin directGNL3GLT8D1 : 52 691 527–52 706 368, brin inverseGLT8D1SPCS1 : 52 704 955–52 711 148, brin directSPCS1NEK4 : 52 708 444–52 770 973, brin inverseNEK4ITIH1 : 52 777 559–52 792 068, brin directITIH1Schéma de GLYCTK : 5 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 52 287 828–52 287 876, 49 basesExon 2 : 52 290 304–52 290 719, 416 basesExon 3 : 52 290 960–52 291 111, 152 basesExon 4 : 52 291 747–52 291 922, 176 basesExon 5 : 52 292 260–52 295 257, 2 998 bases123455′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,8 kb sur les 7,4 kb du gène ; 1 572 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GLYCTK

3

positions dans GLYCTK où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 7,4 kb de GLYCTK, introns compris, et pas seulement les 3,8 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène GLYCTK : glycerate kinase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/glyctk

Vancouver

Dante Labs. Gène GLYCTK : glycerate kinase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/glyctk

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