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Gène

CDH11

cadherin 11

Résumé

Localisation cytogénétique
16q21
Coordonnées
Chromosome 16 : 64 943 753–65 122 063 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 178,3 kb
Protéine
796 acides aminés
Aussi appelé
OB, CAD11
Transcrit MANE Select
ENST00000268603.9NM_001797.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CDH11. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CDH11

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de CDH11. CDH11 et 0 gène à proximité sur le chromosome 16, de 64 532 908 à 65 532 907.Chromosome 1616q21p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.364,6 Mb64,8 Mb65 Mb65,2 Mb65,4 MbCDH11 : 64 943 753–65 122 063, brin inverseCDH11Schéma de CDH11 : 13 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 64 943 753–64 948 099, 4 347 basesExon 12 : 64 950 767–64 951 018, 252 basesExon 11 : 64 971 579–64 971 696, 118 basesExon 10 : 64 971 931–64 972 064, 134 basesExon 9 : 64 972 904–64 973 040, 137 basesExon 8 : 64 982 048–64 982 301, 254 basesExon 7 : 64 988 157–64 988 344, 188 basesExon 6 : 64 991 768–64 991 935, 168 basesExon 5 : 64 992 915–64 993 034, 120 basesExon 4 : 64 998 562–64 998 856, 295 basesExon 3 : 65 004 642–65 005 041, 400 basesExon 2 : 65 053 804–65 053 928, 125 basesExon 1 : 65 121 880–65 122 063, 184 bases131210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,7 kb sur les 178,3 kb du gène ; 2 391 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de CDH11

2Faible

Difficulté de séquençage de CDH11 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions4 %
  • Teneur en GC12 %
  • Couverture de référence0 %

2

positions dans CDH11 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.

Un génome complet couvre les 178,3 kb de CDH11, introns compris, et pas seulement les 6,7 kb d'exons.

Traits associés à CDH11

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que CDH11 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Abnormality of head or neck

Afficher 56 traits supplémentaires

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CDH11 : cadherin 11. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cdh11

Vancouver

Dante Labs. Gène CDH11 : cadherin 11 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cdh11

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