Geeni
VPS41
VPS41 subunit of HOPS complex
- HGNC 12713↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000006715↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 27072↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 7p14.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 7: 38 722 974–38 909 191 (GRCh38)
- Eksonit
- 29 eksonia 186,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 854 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- HVSP41
- MANE Select -transkripti
- ENST00000310301.9NM_014396.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue VPS41 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset autosomaalisesti resessiiviset pikkuaivoataksiat (mm. CANVAS ja AVED)
- Autosomaalisesti resessiivinen pikkuaivoataksiaAutosomaalinen resessiivinen
Yksi 57 siihen liittyvästä geenistä
Ryhmä resessiivisesti periytyviä ataksioita, joita aiheuttavat biallelliset variantit geeneissä, kuten RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 ja SYNE1.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
E-vitamiinin puutokseen liittyvää ataksiaa (TTPA) voidaan hoitaa E-vitamiinilisillä. Muita muotoja hoidetaan fysioterapialla ja oireenmukaisella hoidolla, ja sukulaisille voidaan tarjota kantajatestausta.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
VPS41-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,9 kb geenin 186,2 kb:stä; 2 565 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä VPS41
6
VPS41-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 186,2 kb geenistä VPS41, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 5,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AHI1Abelson helper integration site 1Yhteinen sairaus: 1
- ANO10anoctamin 10Yhteinen sairaus: 1
- ATCAYATCAY kinesin light chain interacting caytaxinYhteinen sairaus: 1
- ATG7autophagy related 7Yhteinen sairaus: 1
- ATP8A2ATPase phospholipid transporting 8A2Yhteinen sairaus: 1
- CA8carbonic anhydrase 8 (inactive)Yhteinen sairaus: 1
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AYhteinen sairaus: 1
- CEP290centrosomal protein 290Yhteinen sairaus: 1
- CEP41centrosomal protein 41Yhteinen sairaus: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Yhteinen sairaus: 1
- COQ8Acoenzyme Q8AYhteinen sairaus: 1
- CSPP1centrosome and spindle pole associated protein 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin VPS41 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita VPS41 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Generalized dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Peripheral axonal neuropathy
- Abnormal lower motor neuron morphology
- Abnormal pyramidal sign
Näytä 21 piirrettä lisää
- Inability to coordinate movements when walking
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Intellectual disability
- Limb ataxia
- Motor delay
- Progressive cerebellar ataxia
- Somatic sensory dysfunction
- Upper motor neuron dysfunction
- Absent speech development
- Cerebellar vermis atrophy
- Impaired proprioception
- Muscle twitch
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Reading disability
- Unsteady walk
- Corpus callosum atrophy
- Degeneration of cerebellum
- Epilepsy
- Eye of the tiger anomaly of globus pallidus
- Iron accumulation in substantia nigra
- Jerking
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). VPS41-geeni: VPS41 subunit of HOPS complex. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vps41
Dante Labs. VPS41-geeni: VPS41 subunit of HOPS complex [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vps41
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa