Geeni
SLC17A5
solute carrier family 17 member 5
- HGNC 10933↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000119899↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 26503↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 6q13
- Koordinaatit
- Kromosomi 6: 73 593 379–73 653 992 (GRCh38)
- Eksonit
- 11 eksonia 60,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 495 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- AST, SD, ISSD, NSD, SIALIN, SLD
- Aiemmat symbolit
- SIASD
- MANE Select -transkripti
- ENST00000355773.6NM_012434.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc17a5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue SLC17A5 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Sallan tauti ja vapaan sialihapon varastoitumistauti
- Sallan tautiAutosomaalinen resessiivinen
Lihasten matala sävy, kehityksen viivästymä, ataksia ja kehitysvammaisuus, jotka alkavat imeväisiässä ja etenevät hitaasti. Tauti on yleisempi Suomessa.
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Hoito on oireenmukaista ja tukevaa, ja siihen kuuluvat esimerkiksi terapia sekä kehityksen tukeminen.
- Imeväisiän vapaan sialihapon varastoitumistautiAutosomaalinen resessiivinen
Vakava tauti, joka alkaa syntymästä tai jo ennen sitä. Siihen liittyy sikiön hydrops, karkeat kasvonpiirteet, elinten suurentuminen ja varhainen kuolema.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Laajemmat ryhmät
Lysosomaalinen varastosairaus
- Lysosomaalinen kertymäsairaus (muut ja määrittelemättömät tyypit)
Yksi 59 siihen liittyvästä geenistä
Kattaa lysosomaaliset kertymäsairaudet, joilla ei ole omaa raporttia, kuten Farberin tauti ja muut ASAH1-geeniin liittyvät sairaudet, prosapsiini- (PSAP) -puutokset, multippeli sulfataasipuutos, mukopolysakkaridoosi tyypit IX ja X sekä Dorfman-Chanarinin tauti. Periytymistapa vaihtelee alatyypeittäin, useimmiten autosomaalisesti resessiivinen.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 7 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
SLC17A5-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,3 kb geenin 60,6 kb:stä; 1 488 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: SLC17A5
145
SLC17A5-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 60,6 kb geenistä SLC17A5, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 3,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- AGAaspartylglucosaminidaseYhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARSAarylsulfatase AYhteinen sairaus: 1
- ARSBarylsulfatase BYhteinen sairaus: 1
- ARSKarylsulfatase family member KYhteinen sairaus: 1
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Yhteinen sairaus: 1
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Yhteinen sairaus: 1
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninYhteinen sairaus: 1
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseYhteinen sairaus: 1
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinYhteinen sairaus: 1
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinYhteinen sairaus: 1
Geeniin SLC17A5 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC17A5 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SLC17A5-geeni: solute carrier family 17 member 5. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc17a5
Dante Labs. SLC17A5-geeni: solute carrier family 17 member 5 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc17a5
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa