Geeni
ICOS
inducible T cell costimulator
- HGNC 5351↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000163600↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 29851↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2q33.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 203 936 763–203 961 577 (GRCh38)
- Eksonit
- 5 eksonia 24,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 199 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- AILIM, CD278
- MANE Select -transkripti
- ENST00000316386.11NM_012092.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue ICOS ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Yleinen muuttuva immuunivajaus (monogeeninen CVID)
- Yleinen muuttuva immuunivajaus
Matala IgG sekä matala IgA ja/tai IgM ja heikko rokotevaste; yksittäisen geenin muotoihin kuuluvat NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 ja TNFRSF13B (TACI).
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Immunoglobuliinikorvaushoito ja infektioiden varhainen hoito ovat vakiohoitoja; geneettinen syy voi ohjata seurantaa autoimmuunisairauksien, lymfooman ja keuhkosairauden varalta, ja jotkin muodot (kuten LRBA-puutos) reagoivat kohdennettuun hoitoon.
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Perinnöllinen immuunipuutos
Yksi 114 siihen liittyvästä geenistä
Immuunijärjestelmän perinnölliset häiriöt, joita aiheuttavat yksittäisten geenien muutokset ja jotka vaikuttavat siihen, miten elimistö torjuu infektioita tai säätelee tulehdusta.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
ICOS-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 24,8 kb:stä; 600 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä ICOS
13
ICOS-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 24,8 kb geenistä ICOS, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CD19CD19 moleculeYhteisiä sairauksia: 3
- CR2complement C3d receptor 2Yhteisiä sairauksia: 3
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Yhteisiä sairauksia: 3
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Yhteisiä sairauksia: 3
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinYhteisiä sairauksia: 3
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Yhteisiä sairauksia: 3
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Yhteisiä sairauksia: 3
- SEC61A1SEC61 translocon subunit alpha 1Yhteisiä sairauksia: 3
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BYhteisiä sairauksia: 3
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin ICOS liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita ICOS voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the immune system
- Combined immunodeficiency
- Partial absence of specific antibody response to unconjugated pneumococcus polysaccharide
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent bronchitis
- Autoimmunity
- Decreased immune function
- Meningitis
- Pneumonia
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ICOS-geeni: inducible T cell costimulator. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/icos
Dante Labs. ICOS-geeni: inducible T cell costimulator [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/icos
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa