Geeni
KRT17
keratin 17
- HGNC 6427↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000128422↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3872↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 17q21.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 17: 41 619 442–41 624 575 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 5,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 432 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- PCHC1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000311208.13NM_000422.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue KRT17 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnölliset kämmenten ja jalkapohjien keratodermat ja pachyonychia congenita
- Perinnöllinen kämmenten ja jalkapohjien keratodermia
Kämmenten ja jalkapohjien perinnöllinen paksuuntuminen, mukaan lukien pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashiman tyypin ja Bothnian keratodermat, keratitis-ichthyosis-deafness-oireyhtymä sekä CTSC-geeniin liittyvät Papillon-Lefèvren ja Haim-Munkin oireyhtymät.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Diagnoosi ohjaa jalkojen hoitoa ja kivunhallintaa. CTSC-geeniin liittyvissä muodoissa varhainen hammashoito suojaa hampaita, ja GJB2-geeniin liittyvissä muodoissa kuulo kannattaa tarkistaa.
KRT17-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1,5 kb geenin 5,1 kb:stä; 1 299 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä KRT17
4
KRT17-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 4 (100 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Segmental duplications (4 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 5,1 kb geenistä KRT17, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1,5 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinYhteinen sairaus: 1
- AP1B1adaptor related protein complex 1 subunit beta 1Yhteinen sairaus: 1
- AQP5aquaporin 5Yhteinen sairaus: 1
- CTSCcathepsin CYhteinen sairaus: 1
- DSG1desmoglein 1Yhteinen sairaus: 1
- DSPdesmoplakinYhteinen sairaus: 1
- GJA1gap junction protein alpha 1Yhteinen sairaus: 1
- GJB2gap junction protein beta 2Yhteinen sairaus: 1
- GJB3gap junction protein beta 3Yhteinen sairaus: 1
- GJB4gap junction protein beta 4Yhteinen sairaus: 1
- GJB6gap junction protein beta 6Yhteinen sairaus: 1
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin KRT17 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita KRT17 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). KRT17-geeni: keratin 17. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/krt17
Dante Labs. KRT17-geeni: keratin 17 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/krt17
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa