Gene
JAGN1
jagunal vesicle mediated transporter 1
- HGNC 26926↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000171135↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 84522↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 3p25.3
- Coordinate
- Cromosoma 3: 9.890.610–9.894.349 (GRCh38)
- Esoni
- 2 esoni su 3,7 kb
- Proteina
- 183 amminoacidi
- Noto anche come
- GL009, FLJ14602
- Trascritto MANE Select
- ENST00000647897.1NM_032492.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Neutropenia congenita grave
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di JAGN1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 1,6 kb dei 3,7 kb del gene; 552 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge JAGN1
8
posizioni in JAGN1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 3,7 kb di JAGN1, introni inclusi, non solo i 1,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- CLPBClpB family mitochondrial disaggregaseCondivide 1 condizione
- CSF3Rcolony stimulating factor 3 receptorCondivide 1 condizione
- CXCR2C-X-C motif chemokine receptor 2Condivide 1 condizione
- G6PC3glucose-6-phosphatase catalytic subunit 3Condivide 1 condizione
- GFI1growth factor independent 1 transcriptional repressorCondivide 1 condizione
- HAX1HCLS1 associated protein X-1Condivide 1 condizione
- SRP54signal recognition particle 54Condivide 1 condizione
- VPS45vacuolar protein sorting 45 homologCondivide 1 condizione
- WASWASP actin nucleation promoting factorCondivide 1 condizione
Tratti collegati a JAGN1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che JAGN1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene JAGN1: jagunal vesicle mediated transporter 1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/jagn1
Dante Labs. Gene JAGN1: jagunal vesicle mediated transporter 1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/jagn1
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