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Gen

JAGN1

jagunal vesicle mediated transporter 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
3p25.3
Koordinaten
Chromosom 3: 9.890.610–9.894.349 (GRCh38)
Exons
2 Exons über 3,7 kb
Protein
183 Aminosäuren
Auch bekannt als
GL009, FLJ14602
MANE-Select-Transkript
ENST00000647897.1NM_032492.4
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierter Bericht zu diesem Gen

Aufbau von JAGN1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 3, mit einer Klammer, an der JAGN1 liegt. JAGN1 und 30 Gene in der Nähe auf Chromosom 3, von 9.392.480 bis 10.392.479.Chromosom 33p25.3p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q299,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbSETD5: 9.397.609–9.479.240, Plus-StrangSETD5LHFPL4: 9.498.361–9.553.862, Minus-StrangLHFPL4MTMR14: 9.649.307–9.702.394, Plus-StrangMTMR14CPNE9: 9.703.691–9.729.908, Plus-StrangCPNE9BRPF1: 9.731.726–9.748.019, Plus-StrangBRPF1OGG1: 9.749.938–9.791.067, Plus-StrangOGG1CAMK1: 9.757.341–9.770.606, Minus-StrangTADA3: 9.779.964–9.793.011, Minus-StrangARPC4: 9.792.484–9.807.704, Plus-StrangARPC4ARPC4-TTLL3: 9.793.082–9.835.401, Plus-StrangARPC4-TTLL3TTLL3: 9.808.086–9.856.087, Plus-StrangTTLL3RPUSD3: 9.831.633–9.844.602, Minus-StrangRPUSD3CIDEC: 9.864.169–9.891.008, Minus-StrangCIDECJAGN1: 9.890.610–9.894.349, Plus-StrangJAGN1IL17RE: 9.902.612–9.916.402, Plus-StrangIL17REIL17RC: 9.917.040–9.933.630, Plus-StrangIL17RC: 9.917.116–9.945.385, Plus-StrangCRELD1: 9.933.791–9.945.413, Plus-StrangPRRT3: 9.939.450–9.952.442, Minus-StrangEMC3: 9.957.217–10.011.202, Minus-StrangEMC3FANCD2: 10.026.370–10.101.937, Plus-StrangFANCD2FANCD2OS: 10.081.317–10.108.290, Minus-StrangFANCD2OSBRK1: 10.115.590–10.135.082, Plus-StrangBRK1VHL: 10.141.764–10.153.676, Plus-StrangVHLIRAK2: 10.164.862–10.243.756, Plus-StrangIRAK2TATDN2: 10.248.023–10.281.218, Plus-StrangTATDN2: 10.249.042–10.249.366, Plus-Strang: 10.249.372–10.285.796, Plus-StrangGHRL: 10.285.666–10.292.959, Minus-StrangGHRLSEC13: 10.293.131–10.321.207, Minus-StrangSEC13ATP2B2: 10.324.023–10.708.060, Minus-StrangATP2B2Diagramm von JAGN1: 2 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 3Exon 1: 5 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 2: 3 bekannte krankheitsverursachende StellenExon 1: 9.890.610–9.890.811, 202 BasenExon 2: 9.892.915–9.894.349, 1.435 Basen125′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,6 kb der 3,7 kb des Gens aus; 552 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest JAGN1

8

Positionen in JAGN1, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 3,7 kb von JAGN1, einschließlich der Introns, und nicht nur die 1,6 kb Exons.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
  • Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (o. J.). JAGN1-Gen: jagunal vesicle mediated transporter 1. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/jagn1

Vancouver

Dante Labs. JAGN1-Gen: jagunal vesicle mediated transporter 1 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/jagn1

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