Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

CXCR2

C-X-C motif chemokine receptor 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2q35
Koordinaadid
Kromosoom 2: 218 126 028–218 137 251 (GRCh38)
Eksonid
3 eksonit, ulatus 11,2 kb
Valk
360 aminohapet
Tuntud ka kui
CMKAR2, CD182
Varasemad tähised
IL8RB
MANE Select transkript
ENST00000318507.7NM_001557.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanne

Kuidas CXCR2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub CXCR2. CXCR2 ja sellele lähedal asuvad 15 geeni kromosoomil 2, vahemikus 217 631 640 kuni 218 631 639.Kromosoom 22q35p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3217,8 Mb218 Mb218,2 Mb218,4 Mb218,6 MbTNS1: 217 799 588–218 033 982, pöördne ahelTNS1RUFY4: 218 034 960–218 090 649, otsene ahelRUFY4CXCR2: 218 126 028–218 137 251, otsene ahelCXCR2CXCR1: 218 162 841–218 166 969, pöördne ahelCXCR1ARPC2: 218 216 630–218 254 356, otsene ahelARPC2GPBAR1: 218 259 496–218 263 861, otsene ahelGPBAR1AAMP: 218 264 125–218 270 889, pöördne ahelAAMPPNKD: 218 269 651–218 347 057, otsene ahelPNKDTMBIM1: 218 274 193–218 292 589, pöördne ahelTMBIM1CATIP: 218 356 838–218 369 962, otsene ahelCATIPSLC11A1: 218 382 006–218 396 906, otsene ahelSLC11A1CTDSP1: 218 397 136–218 405 942, otsene ahelCTDSP1VIL1: 218 419 083–218 453 295, otsene ahelVIL1USP37: 218 450 251–218 568 768, pöördne ahelUSP37CNOT9: 218 568 575–218 597 080, otsene ahelCNOT9PLCD4: 218 607 855–218 637 186, otsene ahelPLCD4CXCR2 skeem: 3 eksonit kromosoomi 2 otsene ahelalEkson 3: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 218 126 028–218 126 353, 326 alustEkson 2: 218 129 314–218 129 365, 52 alustEkson 3: 218 134 777–218 137 251, 2475 alust1235′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,9 kb kogupikkusega 11,2 kb; neist 1083 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse CXCR2

1

koht geenis CXCR2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CXCR2 11,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CXCR2 geen: C-X-C motif chemokine receptor 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cxcr2

Vancouver

Dante Labs. CXCR2 geen: C-X-C motif chemokine receptor 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cxcr2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test