Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

NFX1

nuclear transcription factor, X-box binding 1

Oversigt

Cytogenetisk placering
9p13.3
Koordinater
Kromosom 9: 33.290.516–33.371.157 (GRCh38)
Exoner
24 exoner fordelt over 80,6 kb
Protein
1.120 aminosyrer
Også kendt som
NFX2, MGC20369, Tex42, TEG-42
MANE Select-transkript
ENST00000379540.8NM_002504.6
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser NFX1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er NFX1 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 9, med en klamme ved NFX1. NFX1 og 13 gener i nærheden på kromosom 9, fra 32.830.837 til 33.830.836.Kromosom 99p13.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.333 Mb33,2 Mb33,4 Mb33,6 Mb33,8 MbAPTX: 32.886.601–33.025.176, omvendt-strengAPTXDNAJA1: 33.025.203–33.041.858, fremadrettet-strengDNAJA1SMU1: 33.041.765–33.081.411, omvendt-strengSMU1B4GALT1: 33.100.493–33.167.399, omvendt-strengB4GALT1SPINK4: 33.218.365–33.248.567, fremadrettet-strengSPINK4BAG1: 33.247.820–33.264.720, omvendt-strengBAG1CHMP5: 33.264.017–33.282.071, fremadrettet-strengCHMP5NFX1: 33.290.516–33.371.157, fremadrettet-strengNFX1AQP7: 33.383.133–33.437.236, omvendt-strengAQP7AQP3: 33.441.156–33.447.596, omvendt-strengAQP3NOL6: 33.461.353–33.473.930, omvendt-strengNOL6ANKRD18B: 33.523.522–33.608.848, fremadrettet-strengANKRD18BPRSS3: 33.750.679–33.799.231, fremadrettet-strengPRSS3UBE2R2: 33.817.160–33.920.401, fremadrettet-strengUBE2R2Diagram af NFX1: 24 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 9Exon 1: 33.290.516–33.290.597, 82 baserExon 2: 33.294.420–33.295.427, 1.008 baserExon 3: 33.301.263–33.301.421, 159 baserExon 4: 33.303.191–33.303.268, 78 baserExon 5: 33.307.194–33.307.299, 106 baserExon 6: 33.311.106–33.311.177, 72 baserExon 7: 33.313.654–33.313.793, 140 baserExon 8: 33.318.731–33.318.830, 100 baserExon 9: 33.318.910–33.319.127, 218 baserExon 10: 33.328.581–33.328.678, 98 baserExon 11: 33.332.472–33.332.502, 31 baserExon 12: 33.338.510–33.338.589, 80 baserExon 13: 33.342.746–33.342.854, 109 baserExon 14: 33.344.069–33.344.188, 120 baserExon 15: 33.347.038–33.347.117, 80 baserExon 16: 33.351.560–33.351.790, 231 baserExon 17: 33.352.646–33.352.719, 74 baserExon 18: 33.354.086–33.354.187, 102 baserExon 19: 33.354.851–33.354.892, 42 baserExon 20: 33.364.010–33.364.108, 99 baserExon 21: 33.364.708–33.364.774, 67 baserExon 22: 33.366.629–33.366.774, 146 baserExon 23: 33.367.515–33.367.619, 105 baserExon 24: 33.369.906–33.371.157, 1.252 baser1246810121416182022245′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 4,6 kb af genets 80,6 kb; 3.363 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af NFX1

0Let

Hvor svær NFX1 er at sekventere med korte reads, ud af 100

Næsten alle NFX1s exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.

Det, der lægger oven i: andelen af NFX1s exons i hver type svær region

  • Kortlægbarhed0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser0,4 %
  • GC-indhold0 %
  • Referencedækning0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores det

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). NFX1-genet: nuclear transcription factor, X-box binding 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/nfx1

Vancouver

Dante Labs. NFX1-genet: nuclear transcription factor, X-box binding 1 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/nfx1

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test