Gen
PCDH15
protocadherin related 15
- HGNC 14674↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000150275↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 65217↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 10q21.1
- Souřadnice
- Chromozom 10: 53 802 771–54 801 231 (GRCh38)
- Exony
- 38 exonů na 998,5 kb
- Protein
- 1 740 aminokyselin
- Další názvy
- CDHR15
- Předchozí symboly
- USH1F, DFNB23
- Transkript MANE Select
- ENST00000644397.2NM_001384140.1
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pcdh15.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si PCDH15 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Usher Syndrome
- Autozomálně recesivní
A group of recessive conditions (types 1 to 4) causing sensorineural hearing loss, progressive retinitis pigmentosa and, in some types, balance problems, linked to genes such as USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 and ARSG.
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
An early diagnosis helps with decisions about the timing of cochlear implants, eye monitoring and eligibility for retinal therapy trials, and is relevant to carrier screening.
Širší skupiny
Hearing Loss and Deafness
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
Jeden z 97 genů spojených s touto vazbou
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
Jak je PCDH15 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 9,4 kb z 998,5 kb genu; 5 223 těchto bází kódují protein.
Sekvenování PCDH15
345
pozic v PCDH15, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 998,5 kb genu PCDH15, včetně intronů, nikoli jen 9,4 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CDH23cadherin related 23Sdílí 2 onemocnění
- MYO7Amyosin VIIASdílí 2 onemocnění
- USH1CUSH1 protein network component harmoninSdílí 2 onemocnění
- WHRNwhirlinSdílí 2 onemocnění
- ACTG1actin gamma 1Sdílí 1 onemocnění
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Sdílí 1 onemocnění
- AFG2BAAA ATPase AFG2BSdílí 1 onemocnění
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Sdílí 1 onemocnění
- ARSGarylsulfatase GSdílí 1 onemocnění
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ASdílí 1 onemocnění
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Sdílí 1 onemocnění
- CABP2calcium binding protein 2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s PCDH15
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PCDH15. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PCDH15: protocadherin related 15. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pcdh15
Dante Labs. Gen PCDH15: protocadherin related 15 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pcdh15
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů