Geen
PCDH15
protocadherin related 15
- HGNC 14674↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000150275↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 65217↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 10q21.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 10: 53 802 771–54 801 231 (GRCh38)
- Eksonid
- 38 eksonit, ulatus 998,5 kb
- Valk
- 1740 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- CDHR15
- Varasemad tähised
- USH1F, DFNB23
- MANE Select transkript
- ENST00000644397.2NM_001384140.1
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe PCDH15 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Usheri sündroom
- Autosoomne retsessiivne
Retsessiivsete haiguste rühm (tüübid 1 kuni 4), mis põhjustab sensoneuraalset kuulmiskahjustust, progresseeruvat retinitis pigmentosat ning mõnel tüübil tasakaaluhäireid. Seotud geenidega USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 ja ARSG.
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Varajane diagnoos aitab otsustada koklea-implantaadi paigaldamise aja, silmade jälgimise ning silmanetkkirurgia (retinaalse ravi) uuringutes osalemise üle ning on oluline kandjaskriiningu seisukohalt.
Laiemad rühmad
Kuulmislangus ja kurtus
- Mittesündroomiline pärilik kuulmislangus
Üks 97 sellega seotud geenist
Pärilik kuulmislangus ilma muude meditsiiniliste tunnusteta, sh levinud retsessiivsed vormid, mis on põhjustatud geenidest GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja paljudest teistest geenidest, samuti dominantsed, X-seotud ja mitokondriaalsed vormid.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geneetilise põhjuse teadmine võib aidata otsustada kuulmistoe ja koklea-implantaadi kasutuse üle, hinnata sobivust geeniteraapia uuringutesse (näiteks OTOF) ning toetada perekonna nõustamist.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas PCDH15 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 9,4 kb kogupikkusega 998,5 kb; neist 5223 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse PCDH15
345
kohad geenis PCDH15, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PCDH15 998,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- CDH23cadherin related 23Jagab 2 haigust
- MYO7Amyosin VIIAJagab 2 haigust
- USH1CUSH1 protein network component harmoninJagab 2 haigust
- WHRNwhirlinJagab 2 haigust
- ACTG1actin gamma 1Jagab 1 haigust
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Jagab 1 haigust
- AFG2BAAA ATPase AFG2BJagab 1 haigust
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Jagab 1 haigust
- ARSGarylsulfatase GJagab 1 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 1 haigust
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Jagab 1 haigust
- CABP2calcium binding protein 2Jagab 1 haigust
Geeniga PCDH15 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PCDH15 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). PCDH15 geen: protocadherin related 15. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pcdh15
Dante Labs. PCDH15 geen: protocadherin related 15 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pcdh15
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast