Gen
NDUFS7
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7
- HGNC 7714↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000115286↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 374291↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 19p13.3
- Koordinatlar
- Kromozom 19: 1.383.907–1.395.584 (GRCh38)
- Eksonlar
- 11,7 kb boyunca 8 ekson
- Protein
- 213 amino asit
- Diğer adları
- PSST, FLJ46880, FLJ45860, CI-20
- MANE Select transkripti
- ENST00000233627.14NM_024407.5
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufs7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameNDUFS7 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Leigh Sendromu
Buna bağlı 69 gen arasından biri
Beyin sapı ve bazal ganglion lezyonlarıyla ilişkili, belirli nöropatolojik özelliklerle tanımlanan, ilerleyici bir nörolojik hastalıktır.
- ClinGen bu ilişkiyi orta olarak değerlendiriyor
Primer Mitokondriyal Hastalık
- Mitokondriyal Solunum Zinciri Kompleks Eksikliği
Buna bağlı 61 gen arasından biri
Nükleer ya da mitokondriyal genlerdeki varyantlardan kaynaklanan, I, II, III, IV veya V. komplekslerin izole eksiklikleridir. Beyin, kaslar, kalp, karaciğer ve enerji gereksinimi yüksek diğer organları etkileyebilir.
- 3 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Bu durumu bilmek tanı arayışını sonlandırabilir ve etkilenen organların izlenmesine ve mitokondriler için toksik ilaçlardan kaçınılmasına yol gösterebilir.
NDUFS7 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 11,7 kb uzunluğunun 0,8 kb'sini oluşturur; bu bazların 642 tanesi proteini kodlar.
NDUFS7 dizilemesi
11Orta
Kısa okumalarla NDUFS7 dizilemesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
NDUFS7 geninin ekzonlarından bazıları, kısa okumaların bir değişikliği kaçırabileceği veya yanlış yerleştirebileceği yerlerde bulunuyor.
Buna katkıda bulunan etken: NDUFS7 geninin ekzonlarının her zorluk türündeki bölgelerde bulunan oranı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 baz çiftlik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki kopyalar, örneğin paralog ve psödogenler, %90 veya daha yüksek benzerlikle bulunan segmental duplikasyonlar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kayabildiği ve tam olarak kapsayamadığı ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarlandığı diziler. Ağırlık %15.%5,7
- GC içeriğiG ve C oranının %25'in altında veya %65'in üzerinde olduğu pencereler; kütüphane hazırlığı bu bölgeleri seyrek kapsar. Ağırlık %10.%100
- Referans kapsamıReferans birleştirmesindeki, okumaların hizalanabileceği dizi bulunmayan yakın boşluklar. Ağırlık %10.%0
Dante Labs'ın kendi araştırmasına dayanan bir Dante Labs puanı; NIST'in zor dizilenen bölgelere ilişkin Genome in a Bottle haritalarına dayanır.Puan nasıl hesaplanırHer çubuk, NDUFS7 geninin ekzon bazlarının o zor bölge türünde bulunan oranını gösterir. Puan, her bölgenin bir kısa okuma çağrısına ne kadar maliyet getirdiğine göre ağırlıklandırılır: hiçbir baz herhangi bir bölgede değilse 0, her baz tüm bölgelerdeyse 100.
10
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı, NDUFS7 içindeki değişikliklerin konumları
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom dizilemesi, NDUFS7 geninin yalnızca 0,8 kb'lik ekzonlarını değil, intronlar dahil tüm 11,7 kb'lik bölgesini kapsar.
ClinVar pathogenic variants (10)
The NDUFS7 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patojenik/muhtemelen patojenik 1
- Muhtemelen patojenik 9
| Varyant | Conditions | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_024407.5(NDUFS7):c.364G>A (p.Val122Met) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.256C>G (p.Leu86Val) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.304G>A (p.Asp102Asn) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.339_348del (p.Arg115fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.343_352dup (p.Asp118fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.345_354del (p.Gln116fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.408+1G>C (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.415G>A (p.Asp139Asn) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.455+2T>C (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.537C>A (p.Tyr179Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX102 durumu paylaşıyor
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 12 durumu paylaşıyor
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containing2 durumu paylaşıyor
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 durumu paylaşıyor
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A132 durumu paylaşıyor
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A22 durumu paylaşıyor
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A92 durumu paylaşıyor
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 22 durumu paylaşıyor
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 52 durumu paylaşıyor
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 62 durumu paylaşıyor
- NDUFAF8NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 82 durumu paylaşıyor
- NDUFB8NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B82 durumu paylaşıyor
NDUFS7 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, NDUFS7 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-18 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.18-8b139e39.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). NDUFS7 geni: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ndufs7
Dante Labs. NDUFS7 geni: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ndufs7
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde