Geen
NDUFS7
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7
- HGNC 7714↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000115286↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 374291↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 19p13.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 19: 1 383 907–1 395 584 (GRCh38)
- Eksonid
- 8 eksonit, ulatus 11,7 kb
- Valk
- 213 aminohapet
- Tuntud ka kui
- PSST, FLJ46880, FLJ45860, CI-20
- MANE Select transkript
- ENST00000233627.14NM_024407.5
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufs7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe NDUFS7 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Leigh'i sündroom
Üks 69 sellega seotud geenist
Progresseeruv neuroloogiline haigus, mida iseloomustavad spetsiifilised neuropatoloogilised tunnused, mis seovad ajutüve ja basaalganglionide kahjustused.
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
Primaarne mitokondriaalne haigus
- Mitokondriaalse hingamisahela kompleksi puudulikkus
Üks 61 sellega seotud geenist
Kompleksi I, II, III, IV või V isoleeritud puudulikkus, mida põhjustavad tuuma- või mitokondriaalsete geenide variandid. See võib mõjutada aju, lihaseid, südant, maksa ja teisi energiavajadusega elundeid.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Teadmine võib lõpetada diagnoosiotsingu ning suunata mõjutatud elundite jälgimist ja mitokondritele toksiliste ravimite vältimist.
Harvinaised pärilikud perifeersed neuropaatiad
- Pärilik perifeerne neuropaatia
Üks 233 sellega seotud geenist
Põhjustatud muutustest ühes paljudest geenidest, mis on vajalikud pikkade närvikiudude tervena hoidmiseks. Käesolevas raportis hõlmavad need geene IGHMBP2 ja PLEKHG5, mis on retsessiivsed.
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
▶Tegevusvõimalikkus
Füsioteraapia, ortoosid ja tegevusteraapia aitavad säilitada liikumisvõimet, vajadusel tehakse jaladeformatsioonide korral operatsioon. Mõnel vormil on vaja jälgida hingamist. Geneetiline nõustamine juhendab sugulaste testimist vastavalt asjaomase geeni pärimistüübile.
Kuidas NDUFS7 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 0,8 kb kogupikkusega 11,7 kb; neist 642 alust kodeerivad valku.
NDUFS7 sekveneerimine
11Keskmine
Kui raske on geeni NDUFS7 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100
0 · Lihtne100 · Raske
Osa geeni NDUFS7 eksonitest asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.
Mis sellele lisaks mõjub: geeni NDUFS7 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tuvastus puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ehk ei kata. Kaal 15%.5,7%
- GC-sisaldusAknad, kus G ja C osakaal on alla 25% või üle 65%, mida raamatukogu valmistamine katab hõredalt. Kaal 10%.100%
- Referentsi katvusLõhed referentsassamblees läheduses, kus puudub järjestus, millele lugemid joonduda saaksid. Kaal 10%.0%
Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakseIga tulp näitab geeni NDUFS7 eksonite aluspaaridest selle raskesti loetava piirkonna liigi osakaalu. Üks liik võib geeni iseseisvalt raskeks teha ja iga järgmine lisab vähem: 0, kui ükski aluspaar ei kuulu ühtegi sellisesse piirkonda, 100, kui iga aluspaar asub kohas, kuhu lugemid ei saa üheselt paigutada.
10
positsioonid geenis NDUFS7, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti tabavad.
Terve genoom katab kogu geeni NDUFS7 11,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksonite 0,8 kb.
ClinVar pathogenic variants (10)
The NDUFS7 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne 1
- Tõenäoliselt patogeenne 9
| Variant | Conditions | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|
| NM_024407.5(NDUFS7):c.364G>A (p.Val122Met) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.256C>G (p.Leu86Val) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.304G>A (p.Asp102Asn) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.339_348del (p.Arg115fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.343_352dup (p.Asp118fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.345_354del (p.Gln116fs) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.408+1G>C (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.415G>A (p.Asp139Asn) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.455+2T>C (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
| NM_024407.5(NDUFS7):c.537C>A (p.Tyr179Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 3 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★1 täht 4-st kriteeriumid esitatud, üks esitaja |
Samade haigustega seotud geenid
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Jagab 3 haigust
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Jagab 3 haigust
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingJagab 3 haigust
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Jagab 3 haigust
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Jagab 3 haigust
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Jagab 3 haigust
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Jagab 3 haigust
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Jagab 3 haigust
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Jagab 3 haigust
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Jagab 3 haigust
- NDUFAF8NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 8Jagab 3 haigust
- NDUFB8NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B8Jagab 3 haigust
Geeniga NDUFS7 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida NDUFS7 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-19: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.19-9814e911.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). NDUFS7 geen: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ndufs7
Dante Labs. NDUFS7 geen: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S7 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ndufs7
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast