Gen
MSX2
msh homeobox 2
- HGNC 7392↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000120149↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 4488↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 5q35.2
- Coördinaten
- Chromosoom 5: 174.724.582–174.730.896 (GRCh38)
- Exons
- 2 exons over 6,3 kb
- Eiwit
- 267 aminozuren
- Ook bekend als
- CRS2, FPP, HOX8, MSH, PFM
- Eerdere symbolen
- PFM1
- MANE Select-transcript
- ENST00000239243.7NM_002449.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees MSX2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Syndromale craniosynostose
Aandoeningen waarbij vroegtijdig sluiten van schedelnaden samengaat met andere kenmerken, waaronder het syndroom van Apert, Crouzon, Pfeiffer, Muenke en Saethre-Chotzen, veroorzaakt door genen zoals FGFR2, FGFR3, FGFR1, TWIST1, TCF12 en ERF.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Een vroege diagnose maakt tijdige operatie en controle van de hoofdgroei, het zicht en het gehoor mogelijk; mildere vormen, zoals het syndroom van Muenke, kunnen bij volwassenen onopgemerkt blijven, wat relevant is voor gezinsplanning.
Opbouw van MSX2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,2 kb van de 6,3 kb van het gen; 804 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest MSX2 leest
3
posities in MSX2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
2 daarvan (67%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Segmental duplications (2 posities)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een volledig genoom dekt alle 6,3 kb van MSX2, inclusief introns, en niet alleen de 2,2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CYP26B1cytochrome P450 family 26 subfamily B member 1Deelt 1 aandoening
- ERFETS2 repressor factorDeelt 1 aandoening
- FGFR1fibroblast growth factor receptor 1Deelt 1 aandoening
- FGFR2fibroblast growth factor receptor 2Deelt 1 aandoening
- FGFR3fibroblast growth factor receptor 3Deelt 1 aandoening
- IFT122intraflagellar transport 122Deelt 1 aandoening
- IFT43intraflagellar transport 43Deelt 1 aandoening
- IFT52intraflagellar transport 52Deelt 1 aandoening
- IL11RAinterleukin 11 receptor subunit alphaDeelt 1 aandoening
- KAT6Alysine acetyltransferase 6ADeelt 1 aandoening
- MEGF8multiple EGF like domains 8Deelt 1 aandoening
- PORcytochrome p450 oxidoreductaseDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan MSX2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die MSX2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Deformity of the skull
- Holes in parietal bones
- Abnormal posterior cranial fossa morphology
- Bicoronal synostosis
- Big calvaria
- Broad head shape
- Cleft soft palate
- Extra bones within cranial sutures
Toon 15 kenmerken meer
- Extra teeth
- Metopic synostosis
- Scalp tenderness
- Tall shaped head
- Triangular head shape
- Unicoronal synostosis
- Brain tissue sticks out through back of skull
- Cleft lip
- Cleft palate
- Congenital craniofacial dysostosis
- Cleft upper lip
- Cranium bifidum occultum
- Encephalocele
- Frontal bossing
- Widely patent fontanelles and sutures
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). MSX2-gen: msh homeobox 2. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/msx2
Dante Labs. MSX2-gen: msh homeobox 2 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/msx2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken