Gen
COL4A4
collagen type IV alpha 4 chain
- HGNC 2206↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000081052↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 1286↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q36.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 227.002.714–227.164.205 (GRCh38)
- Exons
- 48 exons over 161,5 kb
- Eiwit
- 1.690 aminozuren
- Ook bekend als
- CA44
- MANE Select-transcript
- ENST00000396625.5NM_000092.5
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/col4a4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees COL4A4 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Alport-syndroom
Een zeldzame nieraandoening die wordt gekenmerkt door glomerulaire nefropathie met hematurie die voortschrijdt tot terminale nierinsufficiëntie (ESRD), vaak gepaard gaande met sensorineuraal doofheid en soms met oogafwijkingen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 7 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
ACE-remmers (ramipril, eerstekeuze, bij voorkeur vóór het ontstaan van proteïnurie); ARB's bij intolerantie voor ACE-remmers; niertransplantatie bij ESRD; gehoorapparaten; jaarlijkse oftalmologische en audiologische controles
Opbouw van COL4A4
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 10 kb van de 161,5 kb van het gen; 5.073 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van COL4A4
720
posities in COL4A4 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
1 daarvan (0,1%) valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
- Low mappability (1 locatie)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een whole genome dekt alle 161,5 kb van COL4A4, inclusief intronen, en niet alleen de 10 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan COL4A4
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die COL4A4 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the genitourinary system
- Glomerular basement membrane lamellation
- Renal failure
- Chronic kidney disease
- Multiple kidney cysts
- Stage 5 chronic kidney disease
- Focal segmental glomerulosclerosis
- Kidney inflammation
- Nephrotic syndrome
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). COL4A4-gen: collagen type IV alpha 4 chain. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/col4a4
Dante Labs. COL4A4-gen: collagen type IV alpha 4 chain [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/col4a4
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken