Genas
KLF1
KLF transcription factor 1
- HGNC 6345↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000105610↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 10661↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 19p13.13
- Koordinatės
- Chromosoma 19: 12 884 422–12 887 201 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 2,8 kb
- Baltymas
- 362 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- EKLF
- MANE Select transkriptas
- ENST00000264834.6NM_006563.5
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/klf1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite KLF1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Įgimtos diseritropoetinės anemijos
- Įgimta diseritropoetinė anemija
Ligų grupė (I–IV tipai ir susiję variantai), kurią sukelia tokių genų kaip CDAN1, CDIN1, SEC23B, KIF23, KLF1 ir GATA1 pokyčiai. Dažniausiai paveldima autosominiu recesyviniu būdu, kai kurios formos – dominantiniu.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Diagnozė padeda parinkti geležies pertekliaus stebėseną ir gydymą, nes jis gali išsivystyti net ir be perpylimų; I tipo atveju gali padėti interferonas alfa.
Kaip išdėstytas KLF1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,6 kb iš 2,8 kb geno; 1 089 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: KLF1
7Maža
Kiek sunku sekti KLF1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo KLF1 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.2,9 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.62 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
9
KLF1 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 2,8 kb geno KLF1, įskaitant intronus, o ne tik 1,6 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
Savybės, susijusios su KLF1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti KLF1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Anisopoikilocytosis
- Blood cancer
- Circulating nucleated red blood cells
- Decreased hemoglobin concentration
- Decreased mean corpuscular hemoglobin concentration
- Decreased mean corpuscular volume
- Erythroid dysplasia
- Erythroid hyperplasia
Rodyti dar 18 savybių
- Hemoglobin Barts
- Hemolytic anemia
- Hypochromia
- Increased immature red blood cells
- Increased RBC distribution width
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Persistence of hemoglobin F
- Poikilocytosis
- Polychromasia
- Reduced hematocrit
- Reduced red cell pyruvate kinase level
- Schistocytosis
- Unequal size of red blood cells
- HbS hemoglobin
- Target cells
- Hypochromic microcytic anemia
- Increased red cell sickling tendency
- Anemia of inadequate production
Laboratory abnormality
- Conjugated hyperbilirubinemia
- Decreased circulating haptoglobin concentration
- High bili total
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Unconjugated hyperbilirubinemia
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- High blood bilirubin levels
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-e609d43e.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). KLF1 genas: KLF transcription factor 1. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/klf1
Dante Labs. KLF1 genas: KLF transcription factor 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/klf1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites