Gén
ZNF699
zinc finger protein 699
- HGNC 24750↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000196110↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 374879↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 19p13.2
- Koordináták
- 19. kromoszóma: 9 291 140–9 309 838 (GRCh38)
- Exonok
- 6 exon, összesen 18,7 kb
- Fehérje
- 642 aminosav
- Más néven ismert
- FLJ38144
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000591998.6NM_198535.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/znf699.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a ZNF699-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZNF699 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.
A ZNF699 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 18,7 kb-jából 6,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1929 bázis kódolja a fehérjét.
ZNF699 szekvenálása
8Könnyű
Mennyire nehéz a ZNF699 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A ZNF699 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a ZNF699 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.23%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.4,6%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a ZNF699 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
9
a ZNF699 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a ZNF699 mind a 18,7 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 6,8 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (9)
The ZNF699 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 6
- Valószínűleg patogén 3
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_198535.3(ZNF699):c.1310_1311del (p.His437fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_198535.3(ZNF699):c.1491_1492del (p.His497fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.436_439del (p.Asp146fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.339del (p.Cys113fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.175+1G>A (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.159_166delinsTTCTTA (p.Gln53fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.826A>T (p.Lys276Ter) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.421_424del (p.Glu141fs) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_198535.3(ZNF699):c.358G>T (p.Glu120Ter) (opens in a new tab) | DEGCAGS syndrome | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
A(z) ZNF699 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) ZNF699 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal spleen morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Dysplastic pulmonary valve
- Elevated heart rate
- Enlarged liver and spleen
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Narrowing of pulmonic valve
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the digestive system
- Intestinal atresia
- Jejunal atresia
- Acid reflux
- Enlarged liver
- Feeding difficulties
- Nasogastric tube feeding
- Oral-pharyngeal dysphagia
- Poor suck
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal renal cortex morphology
- Abnormal renal medulla morphology
- Ambiguous external genitalia
- Bilateral renal dysplasia
- Bilateral renal hypoplasia
- Chordee
- Chronic kidney disease
- Frequent urinary tract infections
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of limbs
- Webbed fingers or toes
- Asymmetric overgrowth
- Club feet
- Extra thumb
- Fused toes
- Hemihypotrophy of lower limb
- Knock knees
- More than five fingers or toes on hands or feet
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ZNF699 gén: zinc finger protein 699. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/znf699
Dante Labs. ZNF699 gén: zinc finger protein 699 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/znf699
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt