Gén
SELENOI
selenoprotein I
- HGNC 29361↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000138018↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 85465↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 2p23.3
- Koordináták
- 2. kromoszóma: 26 346 143–26 395 885 (GRCh38)
- Exonok
- 10 exon, összesen 49,7 kb
- Fehérje
- 397 aminosav
- Más néven ismert
- KIAA1724, SELI, SEPI
- Korábbi jelölések
- EPT1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000260585.12NM_033505.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/selenoi.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SELENOI-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Hereditary Spastic Paraplegia
- Hereditary Spastic Paraplegia (All Types)
A 66 hozzá kapcsolódó gén egyike
Umbrella term covering all hereditary spastic paraplegias, including SPG4 (SPAST), the most common dominant form, and SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 and SPG31.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A SELENOI felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 49,7 kb-jából 8,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1194 bázis kódolja a fehérjét.
SELENOI szekvenálása
1Alacsony
Mennyire nehéz a SELENOI szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy SELENOI exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.3,8%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.5,2%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 11 betegséget oszt meg
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipase1 betegséget oszt meg
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A11 betegséget oszt meg
- AMFRautocrine motility factor receptor1 betegséget oszt meg
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 11 betegséget oszt meg
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 11 betegséget oszt meg
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 11 betegséget oszt meg
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 11 betegséget oszt meg
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 11 betegséget oszt meg
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 11 betegséget oszt meg
- ATL1atlastin GTPase 11 betegséget oszt meg
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A21 betegséget oszt meg
A(z) SELENOI génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SELENOI gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SELENOI gén: selenoprotein I. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/selenoi
Dante Labs. SELENOI gén: selenoprotein I [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/selenoi
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt