Gène
HMGCR
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase
- HGNC 5006↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000113161↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 3156↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 5q13.3
- Coordonnées
- Chromosome 5 : 75 337 220–75 362 101 (GRCh38)
- Exons
- 20 exons sur 24,9 kb
- Protéine
- 888 acides aminés
- Transcrit MANE Select
- ENST00000287936.9NM_000859.3
- Type de locus
- Protein-coding
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Dystrophie musculaire des ceintures
La dystrophie musculaire des ceintures regroupe de nombreux sous-types aux modes de transmission variés (la valeur diagnostique étant également variable). Les personnes porteuses de variants associés à cette affection devraient consulter un spécialiste de l'appareil locomoteur afin d'obtenir un diagnostic définitif.
- ClinGen juge le lien modéré
- 2 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Structure de HMGCR
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 4,5 kb sur les 24,9 kb du gène ; 2 667 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de HMGCR
2
positions de HMGCR où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 24,9 kb de HMGCR, introns compris, et pas seulement les 4,5 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ANO5anoctamin 5Partage 1 affection
- CAPN3calpain 3Partage 1 affection
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainPartage 1 affection
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainPartage 1 affection
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainPartage 1 affection
- DAG1dystroglycan 1Partage 1 affection
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Partage 1 affection
- DYSFdysferlinPartage 1 affection
- FKRPfukutin related proteinPartage 1 affection
- FKTNfukutinPartage 1 affection
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BPartage 1 affection
- HNRNPDLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D likePartage 1 affection
Traits associés à HMGCR
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que HMGCR peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Axial muscle weakness
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Lower limb amyotrophy
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Type 1 muscle fiber predominance
- Type 2 muscle fiber predominance
Afficher 1 trait supplémentaire
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-17 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.17-8666dff2.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène HMGCR : 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hmgcr
Dante Labs. Gène HMGCR : 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hmgcr
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