Gen
HMGCR
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase
- HGNC 5006↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000113161↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 3156↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5q13.3
- Koordinater
- Kromosom 5: 75 337 220–75 362 101 (GRCh38)
- Exoner
- 20 exoner på 24,9 kb
- Protein
- 888 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000287936.9NM_000859.3
- Lokustyp
- Protein-coding
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hmgcr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs HMGCR, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Muskeldystrofi av typen Limb-Girdle
Muskeldystrofi av typen Limb-girdle definieras som en samling av många undertyper med olika nedärvningsmönster (där möjligheten att ställa diagnos också varierar). Du som är bärare av varianter kopplade till sjukdomen bör vända dig till en specialist inom muskel- och skelettsjukdomar för en säker diagnos.
- ClinGen bedömer kopplingen som måttlig
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är HMGCR uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,5 kb av genens 24,9 kb, och 2 667 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av HMGCR
2
positioner i HMGCR där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.
En helgenomsekvensering täcker alla 24,9 kb av HMGCR, inklusive introner, och inte bara de 4,5 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ANO5anoctamin 5Delar 1 tillstånd
- CAPN3calpain 3Delar 1 tillstånd
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDelar 1 tillstånd
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainDelar 1 tillstånd
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDelar 1 tillstånd
- DAG1dystroglycan 1Delar 1 tillstånd
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Delar 1 tillstånd
- DYSFdysferlinDelar 1 tillstånd
- FKRPfukutin related proteinDelar 1 tillstånd
- FKTNfukutinDelar 1 tillstånd
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDelar 1 tillstånd
- HNRNPDLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D likeDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till HMGCR
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som HMGCR kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Axial muscle weakness
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Lower limb amyotrophy
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced muscle fiber alpha dystroglycan
- Type 1 muscle fiber predominance
- Type 2 muscle fiber predominance
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). HMGCR-genen: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/hmgcr
Dante Labs. HMGCR-genen: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/hmgcr
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor