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Gène

ACAN

aggrecan

Résumé

Localisation cytogénétique
15q26.1
Coordonnées
Chromosome 15 : 88 803 436–88 875 353 (GRCh38)
Exons
19 exons sur 71,9 kb
Protéine
2 568 acides aminés
Aussi appelé
CSPGCP
Symboles précédents
MSK16, CSPG1, AGC1
Transcrit MANE Select
ENST00000560601.4NM_001369268.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ACAN. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ACAN

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de ACAN. ACAN et 13 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 88 339 395 à 89 339 394.Chromosome 1515q26.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.388,4 Mb88,6 Mb88,8 Mb89 Mb89,2 MbMRPL46 : 88 459 128–88 467 638, brin inverseMRPL46 : 88 459 501–88 546 585, brin inverseMRPS11 : 88 467 413–88 525 282, brin directMRPS11DET1 : 88 494 440–88 547 321, brin inverseDET1AEN : 88 620 070–88 632 281, brin directAENISG20 : 88 635 605–88 656 483, brin directISG20ACAN : 88 803 436–88 875 353, brin directACANHAPLN3 : 88 877 289–88 895 597, brin inverseHAPLN3MFGE8 : 88 898 683–88 913 579, brin inverseMFGE8ABHD2 : 89 087 459–89 202 355, brin directABHD2RLBP1 : 89 209 869–89 222 577, brin inverseRLBP1FANCI : 89 243 854–89 318 091, brin directFANCIPOLG : 89 305 198–89 334 972, brin inversePOLGPOLGARF : 89 330 208–89 333 809, brin inversePOLGARFSchéma de ACAN : 19 exons sur le brin direct du chromosome 15Exon 3 : 6 sites connus associés à une maladieExon 4 : 2 sites connus associés à une maladieExon 5 : 2 sites connus associés à une maladieExon 6 : 4 sites connus associés à une maladieExon 7 : 3 sites connus associés à une maladieExon 8 : 5 sites connus associés à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 3 sites connus associés à une maladieExon 11 : 2 sites connus associés à une maladieExon 12 : 17 sites connus associés à une maladieExon 14 : 2 sites connus associés à une maladieExon 15 : 1 site connu associé à une maladieExon 16 : 1 site connu associé à une maladieExon 17 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 88 803 436–88 803 809, 374 basesExon 2 : 88 836 200–88 836 276, 77 basesExon 3 : 88 838 663–88 839 046, 384 basesExon 4 : 88 840 012–88 840 186, 175 basesExon 5 : 88 841 740–88 841 867, 128 basesExon 6 : 88 843 355–88 843 648, 294 basesExon 7 : 88 845 505–88 845 882, 378 basesExon 8 : 88 847 243–88 847 417, 175 basesExon 9 : 88 847 911–88 848 038, 128 basesExon 10 : 88 849 438–88 849 731, 294 basesExon 11 : 88 851 794–88 852 033, 240 basesExon 12 : 88 854 852–88 859 417, 4 566 basesExon 13 : 88 860 326–88 860 439, 114 basesExon 14 : 88 868 216–88 868 329, 114 basesExon 15 : 88 871 382–88 871 540, 159 basesExon 16 : 88 872 003–88 872 085, 83 basesExon 17 : 88 872 881–88 873 025, 145 basesExon 18 : 88 873 842–88 874 024, 183 basesExon 19 : 88 874 405–88 875 353, 949 bases151015195′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9 kb sur les 71,9 kb du gène ; 7 707 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit ACAN

56

positions dans ACAN où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 71,9 kb de ACAN, introns compris, et pas seulement les 9 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ACAN : aggrecan. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/acan

Vancouver

Dante Labs. Gène ACAN : aggrecan [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/acan

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