Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

ACAN

aggrecan

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
15q26.1
Koordinaadid
Kromosoom 15: 88 803 436–88 875 353 (GRCh38)
Eksonid
19 eksonit, ulatus 71,9 kb
Valk
2568 aminohapet
Tuntud ka kui
CSPGCP
Varasemad tähised
MSK16, CSPG1, AGC1
MANE Select transkript
ENST00000560601.4NM_001369268.1
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ACAN veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas ACAN on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 15, millel on sulg kohal, kus asub ACAN. ACAN ja sellele lähedal asuvad 13 geeni kromosoomil 15, vahemikus 88 339 395 kuni 89 339 394.Kromosoom 1515q26.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.388,4 Mb88,6 Mb88,8 Mb89 Mb89,2 MbMRPL46: 88 459 128–88 467 638, pöördne ahelMRPL46: 88 459 501–88 546 585, pöördne ahelMRPS11: 88 467 413–88 525 282, otsene ahelMRPS11DET1: 88 494 440–88 547 321, pöördne ahelDET1AEN: 88 620 070–88 632 281, otsene ahelAENISG20: 88 635 605–88 656 483, otsene ahelISG20ACAN: 88 803 436–88 875 353, otsene ahelACANHAPLN3: 88 877 289–88 895 597, pöördne ahelHAPLN3MFGE8: 88 898 683–88 913 579, pöördne ahelMFGE8ABHD2: 89 087 459–89 202 355, otsene ahelABHD2RLBP1: 89 209 869–89 222 577, pöördne ahelRLBP1FANCI: 89 243 854–89 318 091, otsene ahelFANCIPOLG: 89 305 198–89 334 972, pöördne ahelPOLGPOLGARF: 89 330 208–89 333 809, pöördne ahelPOLGARFACAN skeem: 19 eksonit kromosoomi 15 otsene ahelalEkson 3: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 4: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 5: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 6: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 12: 17 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 14: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 16: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 17: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 88 803 436–88 803 809, 374 alustEkson 2: 88 836 200–88 836 276, 77 alustEkson 3: 88 838 663–88 839 046, 384 alustEkson 4: 88 840 012–88 840 186, 175 alustEkson 5: 88 841 740–88 841 867, 128 alustEkson 6: 88 843 355–88 843 648, 294 alustEkson 7: 88 845 505–88 845 882, 378 alustEkson 8: 88 847 243–88 847 417, 175 alustEkson 9: 88 847 911–88 848 038, 128 alustEkson 10: 88 849 438–88 849 731, 294 alustEkson 11: 88 851 794–88 852 033, 240 alustEkson 12: 88 854 852–88 859 417, 4566 alustEkson 13: 88 860 326–88 860 439, 114 alustEkson 14: 88 868 216–88 868 329, 114 alustEkson 15: 88 871 382–88 871 540, 159 alustEkson 16: 88 872 003–88 872 085, 83 alustEkson 17: 88 872 881–88 873 025, 145 alustEkson 18: 88 873 842–88 874 024, 183 alustEkson 19: 88 874 405–88 875 353, 949 alust151015195′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 9 kb kogupikkusega 71,9 kb; neist 7707 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse ACAN

56

kohad geenis ACAN, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ACAN 71,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). ACAN geen: aggrecan. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/acan

Vancouver

Dante Labs. ACAN geen: aggrecan [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/acan

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test