Geeni
TCN2
transcobalamin 2
- HGNC 11653↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000185339↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6948↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 22q12.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 22: 30 607 174–30 627 271 (GRCh38)
- Eksonit
- 9 eksonia 20,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 427 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- D22S676, D22S750, TC2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000215838.8NM_000355.4
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tcn2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue TCN2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Homokystinuria ja kobalamiinin aineenvaihduntahäiriöt
- Kobalamiinin kuljetuksen ja aineenvaihdunnan synnynnäiset häiriötAutosomaalinen resessiivinen
Sisältää B12-vitamiinin imeytymisen ja kuljetuksen häiriöt, kuten Imerslund-Gräsbeckin oireyhtymän (CUBN, AMN), sisäisen tekijän puutoksen (CBLIF) ja transkobalamiini II -puutoksen (TCN2), sekä solunsisäisen kobalamiinin käsittelyn häiriöt. Ne voivat aiheuttaa megaloblastista anemiaa, hermovaurioita ja kasvun viivästymistä.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedon avulla voidaan tarvittaessa aloittaa elinikäiset B12-vitamiinipistokset tai muu kobalamiinihoito, joka voi ehkäistä anemiaa ja hermostovaurioita.
TCN2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,2 kb geenin 20,1 kb:stä; 1 284 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: TCN2
62
TCN2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 20,1 kb geenistä TCN2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 2,2 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCD4ATP binding cassette subfamily D member 4Yhteinen sairaus: 1
- AMNamnion associated transmembrane proteinYhteinen sairaus: 1
- CBLIFcobalamin binding intrinsic factorYhteinen sairaus: 1
- CD320CD320 moleculeYhteinen sairaus: 1
- CUBNcubilinYhteinen sairaus: 1
- HCFC1host cell factor C1Yhteinen sairaus: 1
- LMBRD1LMBR1 domain containing 1Yhteinen sairaus: 1
- MMAAmetabolism of cobalamin associated AYhteinen sairaus: 1
- MMABmetabolism of cobalamin associated BYhteinen sairaus: 1
- MMACHCmetabolism of cobalamin associated CYhteinen sairaus: 1
- MMADHCmetabolism of cobalamin associated DYhteinen sairaus: 1
- MTR5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferaseYhteinen sairaus: 1
Geeniin TCN2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TCN2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TCN2-geeni: transcobalamin 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tcn2
Dante Labs. TCN2-geeni: transcobalamin 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tcn2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa