Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

SMOC1

SPARC related modular calcium binding 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
14q24.1
Koordinaatit
Kromosomi 14: 69 879 416–70 032 366 (GRCh38)
Eksonit
12 eksonia 153 kb:n alueella
Proteiini
435 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000361956.8NM_001034852.3
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SMOC1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SMOC1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 14, jossa hakasulke osoittaa SMOC1-geenin sijainnin. SMOC1 ja 11 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 14, välillä 69 455 891–70 455 890.Kromosomi 1414q24.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3369,6 Mb69,8 Mb70 Mb70,2 Mb70,4 MbSLC39A9: 69 398 015–69 463 644, juoste eteenpäinSLC39A9PLEKHD1: 69 484 692–69 531 551, juoste eteenpäinPLEKHD1CCDC177: 69 569 498–69 574 890, juoste taaksepäinCCDC177SUSD6: 69 611 567–69 715 144, juoste eteenpäinSUSD6SRSF5: 69 726 822–69 773 904, juoste eteenpäinSRSF5SLC10A1: 69 768 055–69 797 665, juoste taaksepäinSLC10A1SMOC1: 69 879 416–70 032 366, juoste eteenpäinSMOC1SLC8A3: 70 044 215–70 189 480, juoste taaksepäinSLC8A3COX16: 70 325 081–70 416 984, juoste taaksepäinCOX16SYNJ2BP-COX16: 70 326 064–70 417 074, juoste taaksepäinSYNJ2BP-COX16SYNJ2BP: 70 366 499–70 417 102, juoste taaksepäinSYNJ2BPADAM21: 70 417 107–70 460 453, juoste eteenpäinADAM21SMOC1-kaavio: 12 eksonia kromosomin 14 juosteella, eteenpäinEksoni 2: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 4: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 5: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 1: 69 879 416–69 879 777, 362 emästäEkson 2: 69 952 138–69 952 303, 166 emästäEkson 3: 69 953 420–69 953 532, 113 emästäEkson 4: 69 975 715–69 975 814, 100 emästäEkson 5: 69 977 918–69 977 965, 48 emästäEkson 6: 69 992 417–69 992 473, 57 emästäEkson 7: 69 994 400–69 994 480, 81 emästäEkson 8: 70 010 754–70 010 946, 193 emästäEkson 9: 70 011 485–70 011 567, 83 emästäEkson 10: 70 013 386–70 013 491, 106 emästäEkson 11: 70 023 203–70 023 447, 245 emästäEkson 12: 70 030 242–70 032 366, 2 125 emästä1510125′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,7 kb geenin 153 kb:stä; 1 308 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä SMOC1

4

SMOC1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 153 kb geenistä SMOC1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,7 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SMOC1-geeni: SPARC related modular calcium binding 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/smoc1

Vancouver

Dante Labs. SMOC1-geeni: SPARC related modular calcium binding 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/smoc1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test